Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5M8

SRPRB, Signal recognition particle receptor subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRBQ9Y5M8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SRPRBQ9Y5M8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SRPRBQ9Y5M8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SRPRBQ9Y5M8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SRPRBQ9Y5M8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SRPRBQ9Y5M8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SRPRBQ9Y5M8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SRPRBQ9Y5M8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SRPRBQ9Y5M8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SRPRBQ9Y5M8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SRPRBQ9Y5M8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SRPRBQ9Y5M8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SRPRBQ9Y5M8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SRPRBQ9Y5M8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SRPRBQ9Y5M8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SRPRBQ9Y5M8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SRPRBQ9Y5M8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SRPRBQ9Y5M8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SRPRBQ9Y5M8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SRPRBQ9Y5M8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SRPRBQ9Y5M8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SRPRBQ9Y5M8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SRPRBQ9Y5M8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SRPRBQ9Y5M8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SRPRBQ9Y5M8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SRPRBQ9Y5M8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SRPRBQ9Y5M8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SRPRBQ9Y5M8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SRPRBQ9Y5M8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SRPRBQ9Y5M8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SRPRBQ9Y5M8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SRPRBQ9Y5M8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SRPRBQ9Y5M8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SRPRBQ9Y5M8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SRPRBQ9Y5M8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SRPRBQ9Y5M8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SRPRBQ9Y5M8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SRPRBQ9Y5M8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SRPRBQ9Y5M8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SRPRBQ9Y5M8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SRPRBQ9Y5M8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SRPRBQ9Y5M8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SRPRBQ9Y5M8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SRPRBQ9Y5M8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SRPRBQ9Y5M8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SRPRBQ9Y5M8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SRPRBQ9Y5M8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SRPRBQ9Y5M8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SRPRBQ9Y5M8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SRPRBQ9Y5M8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SRPRBQ9Y5M8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SRPRBQ9Y5M8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SRPRBQ9Y5M8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SRPRBQ9Y5M8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SRPRBQ9Y5M8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SRPRBQ9Y5M8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SRPRBQ9Y5M8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SRPRBQ9Y5M8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SRPRBQ9Y5M8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SRPRBQ9Y5M8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SRPRBQ9Y5M8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SRPRBQ9Y5M8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SRPRBQ9Y5M8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SRPRBQ9Y5M8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SRPRBQ9Y5M8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SRPRBQ9Y5M8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SRPRBQ9Y5M8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SRPRBQ9Y5M8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SRPRBQ9Y5M8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SRPRBQ9Y5M8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SRPRBQ9Y5M8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SRPRBQ9Y5M8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SRPRBQ9Y5M8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SRPRBQ9Y5M8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SRPRBQ9Y5M8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SRPRBQ9Y5M8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SRPRBQ9Y5M8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SRPRBQ9Y5M8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SRPRBQ9Y5M8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SRPRBQ9Y5M8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SRPRBQ9Y5M8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SRPRBQ9Y5M8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SRPRBQ9Y5M8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SRPRBQ9Y5M8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SRPRBQ9Y5M8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SRPRBQ9Y5M8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SRPRBQ9Y5M8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SRPRBQ9Y5M8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SRPRBQ9Y5M8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SRPRBQ9Y5M8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SRPRBQ9Y5M8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SRPRBQ9Y5M8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SRPRBQ9Y5M8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SRPRBQ9Y5M8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SRPRBQ9Y5M8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SRPRBQ9Y5M8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SRPRBQ9Y5M8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SRPRBQ9Y5M8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SRPRBQ9Y5M8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SRPRBQ9Y5M8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms