Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNPO3Q9Y5L0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNPO3Q9Y5L0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNPO3Q9Y5L0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNPO3Q9Y5L0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNPO3Q9Y5L0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNPO3Q9Y5L0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNPO3Q9Y5L0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNPO3Q9Y5L0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNPO3Q9Y5L0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNPO3Q9Y5L0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNPO3Q9Y5L0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNPO3Q9Y5L0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNPO3Q9Y5L0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNPO3Q9Y5L0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNPO3Q9Y5L0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNPO3Q9Y5L0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNPO3Q9Y5L0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNPO3Q9Y5L0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNPO3Q9Y5L0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNPO3Q9Y5L0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNPO3Q9Y5L0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNPO3Q9Y5L0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNPO3Q9Y5L0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNPO3Q9Y5L0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNPO3Q9Y5L0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNPO3Q9Y5L0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNPO3Q9Y5L0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNPO3Q9Y5L0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TNPO3Q9Y5L0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNPO3Q9Y5L0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNPO3Q9Y5L0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNPO3Q9Y5L0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNPO3Q9Y5L0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNPO3Q9Y5L0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNPO3Q9Y5L0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNPO3Q9Y5L0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TNPO3Q9Y5L0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNPO3Q9Y5L0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNPO3Q9Y5L0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNPO3Q9Y5L0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNPO3Q9Y5L0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNPO3Q9Y5L0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNPO3Q9Y5L0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNPO3Q9Y5L0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNPO3Q9Y5L0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNPO3Q9Y5L0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNPO3Q9Y5L0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNPO3Q9Y5L0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNPO3Q9Y5L0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNPO3Q9Y5L0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNPO3Q9Y5L0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNPO3Q9Y5L0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNPO3Q9Y5L0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNPO3Q9Y5L0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNPO3Q9Y5L0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNPO3Q9Y5L0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNPO3Q9Y5L0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNPO3Q9Y5L0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNPO3Q9Y5L0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TNPO3Q9Y5L0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNPO3Q9Y5L0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNPO3Q9Y5L0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TNPO3Q9Y5L0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNPO3Q9Y5L0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNPO3Q9Y5L0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNPO3Q9Y5L0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNPO3Q9Y5L0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNPO3Q9Y5L0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNPO3Q9Y5L0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TNPO3Q9Y5L0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNPO3Q9Y5L0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNPO3Q9Y5L0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNPO3Q9Y5L0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNPO3Q9Y5L0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNPO3Q9Y5L0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNPO3Q9Y5L0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNPO3Q9Y5L0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNPO3Q9Y5L0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNPO3Q9Y5L0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNPO3Q9Y5L0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNPO3Q9Y5L0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNPO3Q9Y5L0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNPO3Q9Y5L0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TNPO3Q9Y5L0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNPO3Q9Y5L0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNPO3Q9Y5L0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
TNPO3Q9Y5L0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNPO3Q9Y5L0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TNPO3Q9Y5L0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNPO3Q9Y5L0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNPO3Q9Y5L0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNPO3Q9Y5L0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNPO3Q9Y5L0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TNPO3Q9Y5L0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNPO3Q9Y5L0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNPO3Q9Y5L0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNPO3Q9Y5L0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNPO3Q9Y5L0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNPO3Q9Y5L0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms