Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4W6

AFG3L2, AFG3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2Q9Y4W6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
AFG3L2Q9Y4W6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
AFG3L2Q9Y4W6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
AFG3L2Q9Y4W6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
AFG3L2Q9Y4W6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
AFG3L2Q9Y4W6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
AFG3L2Q9Y4W6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
AFG3L2Q9Y4W6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
AFG3L2Q9Y4W6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
AFG3L2Q9Y4W6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
AFG3L2Q9Y4W6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
AFG3L2Q9Y4W6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
AFG3L2Q9Y4W6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
AFG3L2Q9Y4W6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
AFG3L2Q9Y4W6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
AFG3L2Q9Y4W6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
AFG3L2Q9Y4W6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
AFG3L2Q9Y4W6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
AFG3L2Q9Y4W6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
AFG3L2Q9Y4W6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
AFG3L2Q9Y4W6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
AFG3L2Q9Y4W6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
AFG3L2Q9Y4W6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
AFG3L2Q9Y4W6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
AFG3L2Q9Y4W6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
AFG3L2Q9Y4W6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
AFG3L2Q9Y4W6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
AFG3L2Q9Y4W6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
AFG3L2Q9Y4W6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
AFG3L2Q9Y4W6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
AFG3L2Q9Y4W6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
AFG3L2Q9Y4W6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
AFG3L2Q9Y4W6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
AFG3L2Q9Y4W6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
AFG3L2Q9Y4W6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
AFG3L2Q9Y4W6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
AFG3L2Q9Y4W6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
AFG3L2Q9Y4W6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
AFG3L2Q9Y4W6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
AFG3L2Q9Y4W6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
AFG3L2Q9Y4W6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
AFG3L2Q9Y4W6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
AFG3L2Q9Y4W6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
AFG3L2Q9Y4W6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
AFG3L2Q9Y4W6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
AFG3L2Q9Y4W6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
AFG3L2Q9Y4W6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
AFG3L2Q9Y4W6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
AFG3L2Q9Y4W6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
AFG3L2Q9Y4W6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
AFG3L2Q9Y4W6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
AFG3L2Q9Y4W6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
AFG3L2Q9Y4W6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
AFG3L2Q9Y4W6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
AFG3L2Q9Y4W6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
AFG3L2Q9Y4W6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
AFG3L2Q9Y4W6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
AFG3L2Q9Y4W6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
AFG3L2Q9Y4W6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
AFG3L2Q9Y4W6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
AFG3L2Q9Y4W6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
AFG3L2Q9Y4W6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
AFG3L2Q9Y4W6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
AFG3L2Q9Y4W6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
AFG3L2Q9Y4W6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
AFG3L2Q9Y4W6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
AFG3L2Q9Y4W6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
AFG3L2Q9Y4W6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
AFG3L2Q9Y4W6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
AFG3L2Q9Y4W6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
AFG3L2Q9Y4W6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
AFG3L2Q9Y4W6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
AFG3L2Q9Y4W6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
AFG3L2Q9Y4W6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
AFG3L2Q9Y4W6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
AFG3L2Q9Y4W6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
AFG3L2Q9Y4W6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
AFG3L2Q9Y4W6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
AFG3L2Q9Y4W6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
AFG3L2Q9Y4W6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
AFG3L2Q9Y4W6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
AFG3L2Q9Y4W6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
AFG3L2Q9Y4W6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
AFG3L2Q9Y4W6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
AFG3L2Q9Y4W6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
AFG3L2Q9Y4W6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
AFG3L2Q9Y4W6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
AFG3L2Q9Y4W6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
AFG3L2Q9Y4W6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
AFG3L2Q9Y4W6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
AFG3L2Q9Y4W6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
AFG3L2Q9Y4W6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
AFG3L2Q9Y4W6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
AFG3L2Q9Y4W6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
AFG3L2Q9Y4W6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
AFG3L2Q9Y4W6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
AFG3L2Q9Y4W6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms