Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3T6

R3HCC1, R3H and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1Q9Y3T6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
R3HCC1Q9Y3T6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
R3HCC1Q9Y3T6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
R3HCC1Q9Y3T6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
R3HCC1Q9Y3T6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
R3HCC1Q9Y3T6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
R3HCC1Q9Y3T6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
R3HCC1Q9Y3T6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
R3HCC1Q9Y3T6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
R3HCC1Q9Y3T6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
R3HCC1Q9Y3T6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
R3HCC1Q9Y3T6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
R3HCC1Q9Y3T6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
R3HCC1Q9Y3T6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
R3HCC1Q9Y3T6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
R3HCC1Q9Y3T6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
R3HCC1Q9Y3T6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
R3HCC1Q9Y3T6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
R3HCC1Q9Y3T6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
R3HCC1Q9Y3T6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
R3HCC1Q9Y3T6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
R3HCC1Q9Y3T6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
R3HCC1Q9Y3T6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
R3HCC1Q9Y3T6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
R3HCC1Q9Y3T6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
R3HCC1Q9Y3T6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
R3HCC1Q9Y3T6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
R3HCC1Q9Y3T6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
R3HCC1Q9Y3T6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
R3HCC1Q9Y3T6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
R3HCC1Q9Y3T6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
R3HCC1Q9Y3T6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
R3HCC1Q9Y3T6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
R3HCC1Q9Y3T6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
R3HCC1Q9Y3T6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
R3HCC1Q9Y3T6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
R3HCC1Q9Y3T6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
R3HCC1Q9Y3T6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
R3HCC1Q9Y3T6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
R3HCC1Q9Y3T6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
R3HCC1Q9Y3T6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
R3HCC1Q9Y3T6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
R3HCC1Q9Y3T6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
R3HCC1Q9Y3T6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
R3HCC1Q9Y3T6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
R3HCC1Q9Y3T6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
R3HCC1Q9Y3T6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
R3HCC1Q9Y3T6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
R3HCC1Q9Y3T6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
R3HCC1Q9Y3T6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
R3HCC1Q9Y3T6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
R3HCC1Q9Y3T6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
R3HCC1Q9Y3T6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
R3HCC1Q9Y3T6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
R3HCC1Q9Y3T6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
R3HCC1Q9Y3T6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
R3HCC1Q9Y3T6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
R3HCC1Q9Y3T6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
R3HCC1Q9Y3T6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
R3HCC1Q9Y3T6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
R3HCC1Q9Y3T6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
R3HCC1Q9Y3T6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
R3HCC1Q9Y3T6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
R3HCC1Q9Y3T6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
R3HCC1Q9Y3T6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
R3HCC1Q9Y3T6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
R3HCC1Q9Y3T6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
R3HCC1Q9Y3T6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
R3HCC1Q9Y3T6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
R3HCC1Q9Y3T6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
R3HCC1Q9Y3T6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
R3HCC1Q9Y3T6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
R3HCC1Q9Y3T6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
R3HCC1Q9Y3T6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
R3HCC1Q9Y3T6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
R3HCC1Q9Y3T6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
R3HCC1Q9Y3T6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
R3HCC1Q9Y3T6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
R3HCC1Q9Y3T6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
R3HCC1Q9Y3T6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
R3HCC1Q9Y3T6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
R3HCC1Q9Y3T6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
R3HCC1Q9Y3T6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
R3HCC1Q9Y3T6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
R3HCC1Q9Y3T6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
R3HCC1Q9Y3T6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
R3HCC1Q9Y3T6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
R3HCC1Q9Y3T6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
R3HCC1Q9Y3T6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
R3HCC1Q9Y3T6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
R3HCC1Q9Y3T6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
R3HCC1Q9Y3T6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
R3HCC1Q9Y3T6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
R3HCC1Q9Y3T6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms