Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G0

EFR3B, Protein EFR3 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3BQ9Y2G0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EFR3BQ9Y2G0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
EFR3BQ9Y2G0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EFR3BQ9Y2G0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
EFR3BQ9Y2G0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EFR3BQ9Y2G0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EFR3BQ9Y2G0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EFR3BQ9Y2G0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EFR3BQ9Y2G0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EFR3BQ9Y2G0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EFR3BQ9Y2G0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EFR3BQ9Y2G0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EFR3BQ9Y2G0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EFR3BQ9Y2G0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EFR3BQ9Y2G0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EFR3BQ9Y2G0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EFR3BQ9Y2G0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EFR3BQ9Y2G0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EFR3BQ9Y2G0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EFR3BQ9Y2G0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EFR3BQ9Y2G0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EFR3BQ9Y2G0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EFR3BQ9Y2G0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
EFR3BQ9Y2G0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EFR3BQ9Y2G0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EFR3BQ9Y2G0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EFR3BQ9Y2G0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EFR3BQ9Y2G0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EFR3BQ9Y2G0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EFR3BQ9Y2G0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
EFR3BQ9Y2G0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EFR3BQ9Y2G0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EFR3BQ9Y2G0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EFR3BQ9Y2G0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EFR3BQ9Y2G0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EFR3BQ9Y2G0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EFR3BQ9Y2G0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EFR3BQ9Y2G0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EFR3BQ9Y2G0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EFR3BQ9Y2G0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EFR3BQ9Y2G0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EFR3BQ9Y2G0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EFR3BQ9Y2G0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EFR3BQ9Y2G0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EFR3BQ9Y2G0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EFR3BQ9Y2G0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EFR3BQ9Y2G0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EFR3BQ9Y2G0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
EFR3BQ9Y2G0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
EFR3BQ9Y2G0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EFR3BQ9Y2G0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EFR3BQ9Y2G0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EFR3BQ9Y2G0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EFR3BQ9Y2G0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EFR3BQ9Y2G0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EFR3BQ9Y2G0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
EFR3BQ9Y2G0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
EFR3BQ9Y2G0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EFR3BQ9Y2G0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
EFR3BQ9Y2G0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EFR3BQ9Y2G0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
EFR3BQ9Y2G0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EFR3BQ9Y2G0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EFR3BQ9Y2G0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EFR3BQ9Y2G0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EFR3BQ9Y2G0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EFR3BQ9Y2G0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EFR3BQ9Y2G0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EFR3BQ9Y2G0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EFR3BQ9Y2G0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EFR3BQ9Y2G0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EFR3BQ9Y2G0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EFR3BQ9Y2G0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EFR3BQ9Y2G0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EFR3BQ9Y2G0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EFR3BQ9Y2G0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EFR3BQ9Y2G0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EFR3BQ9Y2G0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EFR3BQ9Y2G0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EFR3BQ9Y2G0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EFR3BQ9Y2G0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EFR3BQ9Y2G0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EFR3BQ9Y2G0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EFR3BQ9Y2G0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EFR3BQ9Y2G0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EFR3BQ9Y2G0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EFR3BQ9Y2G0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EFR3BQ9Y2G0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EFR3BQ9Y2G0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EFR3BQ9Y2G0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EFR3BQ9Y2G0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EFR3BQ9Y2G0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EFR3BQ9Y2G0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EFR3BQ9Y2G0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EFR3BQ9Y2G0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
EFR3BQ9Y2G0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EFR3BQ9Y2G0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EFR3BQ9Y2G0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EFR3BQ9Y2G0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EFR3BQ9Y2G0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms