Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOBEC2Q9Y235 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOBEC2Q9Y235 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOBEC2Q9Y235 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOBEC2Q9Y235 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOBEC2Q9Y235 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APOBEC2Q9Y235 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
APOBEC2Q9Y235 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
APOBEC2Q9Y235 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
APOBEC2Q9Y235 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APOBEC2Q9Y235 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
APOBEC2Q9Y235 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APOBEC2Q9Y235 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOBEC2Q9Y235 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOBEC2Q9Y235 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOBEC2Q9Y235 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOBEC2Q9Y235 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOBEC2Q9Y235 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOBEC2Q9Y235 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOBEC2Q9Y235 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOBEC2Q9Y235 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
APOBEC2Q9Y235 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APOBEC2Q9Y235 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APOBEC2Q9Y235 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APOBEC2Q9Y235 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APOBEC2Q9Y235 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
APOBEC2Q9Y235 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
APOBEC2Q9Y235 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APOBEC2Q9Y235 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APOBEC2Q9Y235 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
APOBEC2Q9Y235 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
APOBEC2Q9Y235 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOBEC2Q9Y235 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOBEC2Q9Y235 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOBEC2Q9Y235 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOBEC2Q9Y235 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
APOBEC2Q9Y235 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOBEC2Q9Y235 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOBEC2Q9Y235 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOBEC2Q9Y235 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOBEC2Q9Y235 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOBEC2Q9Y235 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOBEC2Q9Y235 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOBEC2Q9Y235 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOBEC2Q9Y235 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOBEC2Q9Y235 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOBEC2Q9Y235 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOBEC2Q9Y235 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOBEC2Q9Y235 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOBEC2Q9Y235 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOBEC2Q9Y235 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOBEC2Q9Y235 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOBEC2Q9Y235 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOBEC2Q9Y235 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOBEC2Q9Y235 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
APOBEC2Q9Y235 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOBEC2Q9Y235 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOBEC2Q9Y235 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOBEC2Q9Y235 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOBEC2Q9Y235 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOBEC2Q9Y235 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOBEC2Q9Y235 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOBEC2Q9Y235 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOBEC2Q9Y235 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOBEC2Q9Y235 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
APOBEC2Q9Y235 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOBEC2Q9Y235 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOBEC2Q9Y235 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
APOBEC2Q9Y235 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOBEC2Q9Y235 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOBEC2Q9Y235 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOBEC2Q9Y235 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOBEC2Q9Y235 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOBEC2Q9Y235 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
APOBEC2Q9Y235 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOBEC2Q9Y235 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOBEC2Q9Y235 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOBEC2Q9Y235 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOBEC2Q9Y235 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOBEC2Q9Y235 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOBEC2Q9Y235 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOBEC2Q9Y235 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOBEC2Q9Y235 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOBEC2Q9Y235 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOBEC2Q9Y235 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOBEC2Q9Y235 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOBEC2Q9Y235 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOBEC2Q9Y235 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
APOBEC2Q9Y235 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOBEC2Q9Y235 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOBEC2Q9Y235 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOBEC2Q9Y235 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOBEC2Q9Y235 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOBEC2Q9Y235 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOBEC2Q9Y235 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOBEC2Q9Y235 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
APOBEC2Q9Y235 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOBEC2Q9Y235 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
APOBEC2Q9Y235 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
APOBEC2Q9Y235 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms