Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC12A4Q9UP95 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC12A4Q9UP95 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC12A4Q9UP95 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC12A4Q9UP95 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC12A4Q9UP95 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC12A4Q9UP95 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC12A4Q9UP95 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC12A4Q9UP95 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC12A4Q9UP95 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC12A4Q9UP95 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC12A4Q9UP95 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC12A4Q9UP95 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC12A4Q9UP95 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC12A4Q9UP95 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC12A4Q9UP95 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC12A4Q9UP95 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC12A4Q9UP95 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC12A4Q9UP95 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC12A4Q9UP95 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC12A4Q9UP95 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC12A4Q9UP95 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC12A4Q9UP95 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC12A4Q9UP95 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC12A4Q9UP95 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC12A4Q9UP95 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC12A4Q9UP95 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC12A4Q9UP95 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC12A4Q9UP95 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC12A4Q9UP95 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC12A4Q9UP95 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC12A4Q9UP95 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC12A4Q9UP95 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC12A4Q9UP95 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC12A4Q9UP95 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC12A4Q9UP95 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC12A4Q9UP95 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC12A4Q9UP95 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC12A4Q9UP95 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC12A4Q9UP95 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC12A4Q9UP95 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC12A4Q9UP95 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC12A4Q9UP95 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC12A4Q9UP95 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC12A4Q9UP95 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC12A4Q9UP95 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC12A4Q9UP95 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
SLC12A4Q9UP95 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC12A4Q9UP95 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC12A4Q9UP95 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC12A4Q9UP95 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC12A4Q9UP95 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC12A4Q9UP95 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC12A4Q9UP95 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC12A4Q9UP95 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC12A4Q9UP95 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC12A4Q9UP95 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC12A4Q9UP95 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC12A4Q9UP95 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC12A4Q9UP95 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC12A4Q9UP95 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC12A4Q9UP95 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC12A4Q9UP95 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC12A4Q9UP95 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC12A4Q9UP95 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC12A4Q9UP95 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC12A4Q9UP95 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC12A4Q9UP95 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC12A4Q9UP95 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC12A4Q9UP95 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC12A4Q9UP95 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC12A4Q9UP95 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC12A4Q9UP95 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC12A4Q9UP95 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC12A4Q9UP95 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC12A4Q9UP95 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC12A4Q9UP95 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC12A4Q9UP95 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC12A4Q9UP95 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC12A4Q9UP95 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC12A4Q9UP95 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC12A4Q9UP95 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC12A4Q9UP95 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC12A4Q9UP95 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC12A4Q9UP95 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC12A4Q9UP95 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC12A4Q9UP95 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC12A4Q9UP95 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC12A4Q9UP95 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC12A4Q9UP95 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC12A4Q9UP95 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC12A4Q9UP95 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC12A4Q9UP95 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC12A4Q9UP95 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC12A4Q9UP95 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC12A4Q9UP95 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC12A4Q9UP95 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC12A4Q9UP95 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC12A4Q9UP95 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC12A4Q9UP95 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms