Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS4

PRPF19, Pre-mRNA-processing factor 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF19Q9UMS4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPF19Q9UMS4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPF19Q9UMS4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPF19Q9UMS4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPF19Q9UMS4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPF19Q9UMS4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF19Q9UMS4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF19Q9UMS4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF19Q9UMS4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF19Q9UMS4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF19Q9UMS4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF19Q9UMS4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF19Q9UMS4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF19Q9UMS4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF19Q9UMS4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF19Q9UMS4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF19Q9UMS4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF19Q9UMS4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF19Q9UMS4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF19Q9UMS4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF19Q9UMS4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF19Q9UMS4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF19Q9UMS4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF19Q9UMS4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF19Q9UMS4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF19Q9UMS4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF19Q9UMS4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF19Q9UMS4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF19Q9UMS4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF19Q9UMS4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF19Q9UMS4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPF19Q9UMS4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPF19Q9UMS4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPF19Q9UMS4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPF19Q9UMS4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPF19Q9UMS4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
PRPF19Q9UMS4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF19Q9UMS4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF19Q9UMS4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF19Q9UMS4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF19Q9UMS4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF19Q9UMS4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF19Q9UMS4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF19Q9UMS4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF19Q9UMS4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF19Q9UMS4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF19Q9UMS4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF19Q9UMS4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF19Q9UMS4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PRPF19Q9UMS4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF19Q9UMS4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF19Q9UMS4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF19Q9UMS4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF19Q9UMS4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF19Q9UMS4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF19Q9UMS4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF19Q9UMS4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF19Q9UMS4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPF19Q9UMS4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPF19Q9UMS4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPF19Q9UMS4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPF19Q9UMS4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPF19Q9UMS4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPF19Q9UMS4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPF19Q9UMS4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPF19Q9UMS4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPF19Q9UMS4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPF19Q9UMS4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPF19Q9UMS4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPF19Q9UMS4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPF19Q9UMS4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPF19Q9UMS4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPF19Q9UMS4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPF19Q9UMS4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPF19Q9UMS4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPF19Q9UMS4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPF19Q9UMS4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPF19Q9UMS4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPF19Q9UMS4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPF19Q9UMS4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPF19Q9UMS4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPF19Q9UMS4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPF19Q9UMS4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRPF19Q9UMS4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRPF19Q9UMS4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRPF19Q9UMS4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRPF19Q9UMS4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRPF19Q9UMS4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRPF19Q9UMS4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF19Q9UMS4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF19Q9UMS4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF19Q9UMS4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF19Q9UMS4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF19Q9UMS4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF19Q9UMS4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF19Q9UMS4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF19Q9UMS4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF19Q9UMS4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF19Q9UMS4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF19Q9UMS4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms