Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULS5

TMCC3, Transmembrane and coiled-coil domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC3Q9ULS5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMCC3Q9ULS5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMCC3Q9ULS5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMCC3Q9ULS5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMCC3Q9ULS5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMCC3Q9ULS5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMCC3Q9ULS5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMCC3Q9ULS5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMCC3Q9ULS5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMCC3Q9ULS5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMCC3Q9ULS5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMCC3Q9ULS5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMCC3Q9ULS5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCC3Q9ULS5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCC3Q9ULS5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCC3Q9ULS5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCC3Q9ULS5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMCC3Q9ULS5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TMCC3Q9ULS5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMCC3Q9ULS5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMCC3Q9ULS5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMCC3Q9ULS5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMCC3Q9ULS5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TMCC3Q9ULS5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMCC3Q9ULS5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMCC3Q9ULS5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMCC3Q9ULS5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMCC3Q9ULS5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMCC3Q9ULS5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMCC3Q9ULS5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCC3Q9ULS5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCC3Q9ULS5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCC3Q9ULS5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCC3Q9ULS5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCC3Q9ULS5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCC3Q9ULS5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCC3Q9ULS5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCC3Q9ULS5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCC3Q9ULS5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCC3Q9ULS5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCC3Q9ULS5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCC3Q9ULS5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCC3Q9ULS5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCC3Q9ULS5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCC3Q9ULS5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCC3Q9ULS5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCC3Q9ULS5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCC3Q9ULS5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCC3Q9ULS5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCC3Q9ULS5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCC3Q9ULS5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCC3Q9ULS5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCC3Q9ULS5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCC3Q9ULS5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCC3Q9ULS5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCC3Q9ULS5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCC3Q9ULS5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCC3Q9ULS5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCC3Q9ULS5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCC3Q9ULS5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMCC3Q9ULS5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMCC3Q9ULS5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TMCC3Q9ULS5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMCC3Q9ULS5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMCC3Q9ULS5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCC3Q9ULS5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCC3Q9ULS5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCC3Q9ULS5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCC3Q9ULS5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCC3Q9ULS5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMCC3Q9ULS5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TMCC3Q9ULS5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMCC3Q9ULS5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMCC3Q9ULS5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMCC3Q9ULS5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMCC3Q9ULS5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMCC3Q9ULS5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMCC3Q9ULS5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMCC3Q9ULS5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMCC3Q9ULS5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMCC3Q9ULS5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMCC3Q9ULS5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMCC3Q9ULS5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMCC3Q9ULS5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMCC3Q9ULS5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMCC3Q9ULS5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMCC3Q9ULS5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMCC3Q9ULS5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TMCC3Q9ULS5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMCC3Q9ULS5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCC3Q9ULS5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCC3Q9ULS5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCC3Q9ULS5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCC3Q9ULS5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCC3Q9ULS5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCC3Q9ULS5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCC3Q9ULS5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCC3Q9ULS5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCC3Q9ULS5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCC3Q9ULS5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms