Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJA2

CRLS1, Cardiolipin synthase (CMP-forming), humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRLS1Q9UJA2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRLS1Q9UJA2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRLS1Q9UJA2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRLS1Q9UJA2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRLS1Q9UJA2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRLS1Q9UJA2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CRLS1Q9UJA2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRLS1Q9UJA2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRLS1Q9UJA2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRLS1Q9UJA2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRLS1Q9UJA2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRLS1Q9UJA2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRLS1Q9UJA2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRLS1Q9UJA2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRLS1Q9UJA2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRLS1Q9UJA2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRLS1Q9UJA2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRLS1Q9UJA2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRLS1Q9UJA2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRLS1Q9UJA2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRLS1Q9UJA2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRLS1Q9UJA2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRLS1Q9UJA2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRLS1Q9UJA2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRLS1Q9UJA2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRLS1Q9UJA2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRLS1Q9UJA2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRLS1Q9UJA2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRLS1Q9UJA2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRLS1Q9UJA2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRLS1Q9UJA2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRLS1Q9UJA2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CRLS1Q9UJA2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRLS1Q9UJA2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRLS1Q9UJA2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRLS1Q9UJA2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRLS1Q9UJA2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRLS1Q9UJA2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CRLS1Q9UJA2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRLS1Q9UJA2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CRLS1Q9UJA2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRLS1Q9UJA2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRLS1Q9UJA2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRLS1Q9UJA2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CRLS1Q9UJA2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRLS1Q9UJA2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CRLS1Q9UJA2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CRLS1Q9UJA2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRLS1Q9UJA2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRLS1Q9UJA2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CRLS1Q9UJA2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRLS1Q9UJA2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRLS1Q9UJA2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRLS1Q9UJA2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CRLS1Q9UJA2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRLS1Q9UJA2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRLS1Q9UJA2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRLS1Q9UJA2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRLS1Q9UJA2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CRLS1Q9UJA2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CRLS1Q9UJA2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CRLS1Q9UJA2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRLS1Q9UJA2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRLS1Q9UJA2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRLS1Q9UJA2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CRLS1Q9UJA2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRLS1Q9UJA2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRLS1Q9UJA2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRLS1Q9UJA2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRLS1Q9UJA2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRLS1Q9UJA2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRLS1Q9UJA2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRLS1Q9UJA2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRLS1Q9UJA2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CRLS1Q9UJA2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CRLS1Q9UJA2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CRLS1Q9UJA2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CRLS1Q9UJA2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CRLS1Q9UJA2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CRLS1Q9UJA2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CRLS1Q9UJA2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRLS1Q9UJA2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRLS1Q9UJA2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRLS1Q9UJA2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CRLS1Q9UJA2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CRLS1Q9UJA2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CRLS1Q9UJA2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CRLS1Q9UJA2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRLS1Q9UJA2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRLS1Q9UJA2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRLS1Q9UJA2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRLS1Q9UJA2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRLS1Q9UJA2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRLS1Q9UJA2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CRLS1Q9UJA2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRLS1Q9UJA2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRLS1Q9UJA2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRLS1Q9UJA2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRLS1Q9UJA2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRLS1Q9UJA2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms