Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SCN11AQ9UI33 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SCN11AQ9UI33 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SCN11AQ9UI33 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
SCN11AQ9UI33 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SCN11AQ9UI33 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
SCN11AQ9UI33 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
SCN11AQ9UI33 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC31.72■■■□□ 2.67
SCN11AQ9UI33 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
SCN11AQ9UI33 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
SCN11AQ9UI33 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
SCN11AQ9UI33 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
SCN11AQ9UI33 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
SCN11AQ9UI33 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
SCN11AQ9UI33 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
SCN11AQ9UI33 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
SCN11AQ9UI33 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
SCN11AQ9UI33 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
SCN11AQ9UI33 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
SCN11AQ9UI33 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
SCN11AQ9UI33 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
SCN11AQ9UI33 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
SCN11AQ9UI33 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
SCN11AQ9UI33 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
SCN11AQ9UI33 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
SCN11AQ9UI33 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
SCN11AQ9UI33 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SCN11AQ9UI33 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
SCN11AQ9UI33 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SCN11AQ9UI33 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
SCN11AQ9UI33 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SCN11AQ9UI33 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SCN11AQ9UI33 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SCN11AQ9UI33 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
SCN11AQ9UI33 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SCN11AQ9UI33 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
SCN11AQ9UI33 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
SCN11AQ9UI33 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SCN11AQ9UI33 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
SCN11AQ9UI33 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
SCN11AQ9UI33 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SCN11AQ9UI33 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SCN11AQ9UI33 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SCN11AQ9UI33 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
SCN11AQ9UI33 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
SCN11AQ9UI33 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
SCN11AQ9UI33 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
SCN11AQ9UI33 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
SCN11AQ9UI33 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.65
SCN11AQ9UI33 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC31.63■■■□□ 2.65
SCN11AQ9UI33 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SCN11AQ9UI33 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
SCN11AQ9UI33 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
SCN11AQ9UI33 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
SCN11AQ9UI33 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SCN11AQ9UI33 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
SCN11AQ9UI33 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
SCN11AQ9UI33 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
SCN11AQ9UI33 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC31.61■■■□□ 2.65
SCN11AQ9UI33 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
SCN11AQ9UI33 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
SCN11AQ9UI33 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
SCN11AQ9UI33 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SCN11AQ9UI33 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SCN11AQ9UI33 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
SCN11AQ9UI33 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SCN11AQ9UI33 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SCN11AQ9UI33 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SCN11AQ9UI33 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SCN11AQ9UI33 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SCN11AQ9UI33 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SCN11AQ9UI33 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SCN11AQ9UI33 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SCN11AQ9UI33 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
SCN11AQ9UI33 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
SCN11AQ9UI33 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
SCN11AQ9UI33 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
SCN11AQ9UI33 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SCN11AQ9UI33 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SCN11AQ9UI33 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
SCN11AQ9UI33 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SCN11AQ9UI33 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
SCN11AQ9UI33 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
SCN11AQ9UI33 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
SCN11AQ9UI33 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SCN11AQ9UI33 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SCN11AQ9UI33 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SCN11AQ9UI33 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SCN11AQ9UI33 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
SCN11AQ9UI33 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SCN11AQ9UI33 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SCN11AQ9UI33 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SCN11AQ9UI33 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
SCN11AQ9UI33 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SCN11AQ9UI33 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
SCN11AQ9UI33 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SCN11AQ9UI33 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SCN11AQ9UI33 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
SCN11AQ9UI33 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
SCN11AQ9UI33 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.3 ms