Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
IFT172Q9UG01 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
IFT172Q9UG01 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
IFT172Q9UG01 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC34.86■■■■□ 3.17
IFT172Q9UG01 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
IFT172Q9UG01 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
IFT172Q9UG01 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
IFT172Q9UG01 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
IFT172Q9UG01 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
IFT172Q9UG01 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
IFT172Q9UG01 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
IFT172Q9UG01 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
IFT172Q9UG01 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
IFT172Q9UG01 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
IFT172Q9UG01 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
IFT172Q9UG01 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
IFT172Q9UG01 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
IFT172Q9UG01 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
IFT172Q9UG01 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
IFT172Q9UG01 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
IFT172Q9UG01 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
IFT172Q9UG01 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
IFT172Q9UG01 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
IFT172Q9UG01 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
IFT172Q9UG01 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
IFT172Q9UG01 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
IFT172Q9UG01 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC34.8■■■■□ 3.16
IFT172Q9UG01 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
IFT172Q9UG01 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
IFT172Q9UG01 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
IFT172Q9UG01 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
IFT172Q9UG01 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
IFT172Q9UG01 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
IFT172Q9UG01 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
IFT172Q9UG01 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
IFT172Q9UG01 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
IFT172Q9UG01 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
IFT172Q9UG01 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
IFT172Q9UG01 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
IFT172Q9UG01 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
IFT172Q9UG01 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
IFT172Q9UG01 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
IFT172Q9UG01 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
IFT172Q9UG01 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
IFT172Q9UG01 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
IFT172Q9UG01 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
IFT172Q9UG01 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
IFT172Q9UG01 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
IFT172Q9UG01 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
IFT172Q9UG01 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
IFT172Q9UG01 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
IFT172Q9UG01 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
IFT172Q9UG01 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
IFT172Q9UG01 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
IFT172Q9UG01 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
IFT172Q9UG01 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
IFT172Q9UG01 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
IFT172Q9UG01 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
IFT172Q9UG01 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
IFT172Q9UG01 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
IFT172Q9UG01 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
IFT172Q9UG01 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
IFT172Q9UG01 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
IFT172Q9UG01 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
IFT172Q9UG01 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
IFT172Q9UG01 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
IFT172Q9UG01 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
IFT172Q9UG01 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
IFT172Q9UG01 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
IFT172Q9UG01 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
IFT172Q9UG01 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
IFT172Q9UG01 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
IFT172Q9UG01 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
IFT172Q9UG01 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
IFT172Q9UG01 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
IFT172Q9UG01 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
IFT172Q9UG01 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
IFT172Q9UG01 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
IFT172Q9UG01 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
IFT172Q9UG01 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
IFT172Q9UG01 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
IFT172Q9UG01 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
IFT172Q9UG01 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC34.68■■■■□ 3.14
IFT172Q9UG01 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
IFT172Q9UG01 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
IFT172Q9UG01 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
IFT172Q9UG01 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
IFT172Q9UG01 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
IFT172Q9UG01 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
IFT172Q9UG01 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
IFT172Q9UG01 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
IFT172Q9UG01 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
IFT172Q9UG01 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
IFT172Q9UG01 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
IFT172Q9UG01 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
IFT172Q9UG01 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
IFT172Q9UG01 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
IFT172Q9UG01 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
IFT172Q9UG01 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.14
IFT172Q9UG01 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms