Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CGGBP1Q9UFW8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CGGBP1Q9UFW8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CGGBP1Q9UFW8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CGGBP1Q9UFW8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CGGBP1Q9UFW8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CGGBP1Q9UFW8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CGGBP1Q9UFW8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CGGBP1Q9UFW8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CGGBP1Q9UFW8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CGGBP1Q9UFW8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CGGBP1Q9UFW8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CGGBP1Q9UFW8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CGGBP1Q9UFW8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CGGBP1Q9UFW8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CGGBP1Q9UFW8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CGGBP1Q9UFW8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CGGBP1Q9UFW8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CGGBP1Q9UFW8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CGGBP1Q9UFW8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CGGBP1Q9UFW8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CGGBP1Q9UFW8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CGGBP1Q9UFW8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CGGBP1Q9UFW8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CGGBP1Q9UFW8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CGGBP1Q9UFW8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CGGBP1Q9UFW8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CGGBP1Q9UFW8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CGGBP1Q9UFW8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CGGBP1Q9UFW8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CGGBP1Q9UFW8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CGGBP1Q9UFW8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CGGBP1Q9UFW8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CGGBP1Q9UFW8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CGGBP1Q9UFW8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CGGBP1Q9UFW8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CGGBP1Q9UFW8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CGGBP1Q9UFW8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CGGBP1Q9UFW8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CGGBP1Q9UFW8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CGGBP1Q9UFW8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CGGBP1Q9UFW8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CGGBP1Q9UFW8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CGGBP1Q9UFW8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CGGBP1Q9UFW8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CGGBP1Q9UFW8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CGGBP1Q9UFW8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CGGBP1Q9UFW8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CGGBP1Q9UFW8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CGGBP1Q9UFW8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CGGBP1Q9UFW8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CGGBP1Q9UFW8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CGGBP1Q9UFW8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CGGBP1Q9UFW8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CGGBP1Q9UFW8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CGGBP1Q9UFW8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CGGBP1Q9UFW8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CGGBP1Q9UFW8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CGGBP1Q9UFW8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CGGBP1Q9UFW8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CGGBP1Q9UFW8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CGGBP1Q9UFW8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CGGBP1Q9UFW8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CGGBP1Q9UFW8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CGGBP1Q9UFW8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CGGBP1Q9UFW8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CGGBP1Q9UFW8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CGGBP1Q9UFW8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CGGBP1Q9UFW8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CGGBP1Q9UFW8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CGGBP1Q9UFW8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CGGBP1Q9UFW8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CGGBP1Q9UFW8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CGGBP1Q9UFW8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CGGBP1Q9UFW8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CGGBP1Q9UFW8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CGGBP1Q9UFW8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CGGBP1Q9UFW8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CGGBP1Q9UFW8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CGGBP1Q9UFW8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CGGBP1Q9UFW8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CGGBP1Q9UFW8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CGGBP1Q9UFW8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CGGBP1Q9UFW8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CGGBP1Q9UFW8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CGGBP1Q9UFW8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CGGBP1Q9UFW8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CGGBP1Q9UFW8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CGGBP1Q9UFW8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CGGBP1Q9UFW8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CGGBP1Q9UFW8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CGGBP1Q9UFW8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CGGBP1Q9UFW8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CGGBP1Q9UFW8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CGGBP1Q9UFW8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CGGBP1Q9UFW8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CGGBP1Q9UFW8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CGGBP1Q9UFW8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CGGBP1Q9UFW8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CGGBP1Q9UFW8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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