Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY6

TRIM10, Tripartite motif-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM10Q9UDY6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM10Q9UDY6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM10Q9UDY6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM10Q9UDY6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM10Q9UDY6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM10Q9UDY6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM10Q9UDY6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM10Q9UDY6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM10Q9UDY6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM10Q9UDY6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM10Q9UDY6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM10Q9UDY6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM10Q9UDY6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM10Q9UDY6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM10Q9UDY6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM10Q9UDY6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM10Q9UDY6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM10Q9UDY6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM10Q9UDY6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM10Q9UDY6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM10Q9UDY6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM10Q9UDY6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM10Q9UDY6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM10Q9UDY6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM10Q9UDY6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM10Q9UDY6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM10Q9UDY6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM10Q9UDY6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM10Q9UDY6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM10Q9UDY6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM10Q9UDY6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM10Q9UDY6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM10Q9UDY6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM10Q9UDY6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM10Q9UDY6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM10Q9UDY6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM10Q9UDY6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM10Q9UDY6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM10Q9UDY6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM10Q9UDY6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM10Q9UDY6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM10Q9UDY6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM10Q9UDY6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM10Q9UDY6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM10Q9UDY6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM10Q9UDY6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM10Q9UDY6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM10Q9UDY6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM10Q9UDY6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM10Q9UDY6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM10Q9UDY6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM10Q9UDY6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM10Q9UDY6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM10Q9UDY6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM10Q9UDY6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM10Q9UDY6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM10Q9UDY6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM10Q9UDY6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM10Q9UDY6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM10Q9UDY6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM10Q9UDY6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM10Q9UDY6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM10Q9UDY6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM10Q9UDY6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM10Q9UDY6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM10Q9UDY6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM10Q9UDY6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM10Q9UDY6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM10Q9UDY6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM10Q9UDY6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM10Q9UDY6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM10Q9UDY6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM10Q9UDY6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM10Q9UDY6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRIM10Q9UDY6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRIM10Q9UDY6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRIM10Q9UDY6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRIM10Q9UDY6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM10Q9UDY6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM10Q9UDY6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM10Q9UDY6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM10Q9UDY6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM10Q9UDY6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM10Q9UDY6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM10Q9UDY6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM10Q9UDY6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM10Q9UDY6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM10Q9UDY6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM10Q9UDY6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM10Q9UDY6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM10Q9UDY6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM10Q9UDY6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM10Q9UDY6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM10Q9UDY6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM10Q9UDY6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM10Q9UDY6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM10Q9UDY6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM10Q9UDY6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM10Q9UDY6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM10Q9UDY6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms