Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTNNAL1Q9UBT7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTNNAL1Q9UBT7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTNNAL1Q9UBT7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CTNNAL1Q9UBT7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTNNAL1Q9UBT7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CTNNAL1Q9UBT7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTNNAL1Q9UBT7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTNNAL1Q9UBT7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTNNAL1Q9UBT7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTNNAL1Q9UBT7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTNNAL1Q9UBT7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTNNAL1Q9UBT7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTNNAL1Q9UBT7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTNNAL1Q9UBT7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTNNAL1Q9UBT7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTNNAL1Q9UBT7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTNNAL1Q9UBT7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTNNAL1Q9UBT7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTNNAL1Q9UBT7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTNNAL1Q9UBT7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTNNAL1Q9UBT7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CTNNAL1Q9UBT7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CTNNAL1Q9UBT7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CTNNAL1Q9UBT7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CTNNAL1Q9UBT7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CTNNAL1Q9UBT7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CTNNAL1Q9UBT7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTNNAL1Q9UBT7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CTNNAL1Q9UBT7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CTNNAL1Q9UBT7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CTNNAL1Q9UBT7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTNNAL1Q9UBT7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTNNAL1Q9UBT7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTNNAL1Q9UBT7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTNNAL1Q9UBT7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTNNAL1Q9UBT7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTNNAL1Q9UBT7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTNNAL1Q9UBT7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTNNAL1Q9UBT7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTNNAL1Q9UBT7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTNNAL1Q9UBT7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTNNAL1Q9UBT7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CTNNAL1Q9UBT7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CTNNAL1Q9UBT7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTNNAL1Q9UBT7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTNNAL1Q9UBT7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTNNAL1Q9UBT7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTNNAL1Q9UBT7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CTNNAL1Q9UBT7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CTNNAL1Q9UBT7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CTNNAL1Q9UBT7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTNNAL1Q9UBT7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTNNAL1Q9UBT7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTNNAL1Q9UBT7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTNNAL1Q9UBT7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTNNAL1Q9UBT7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTNNAL1Q9UBT7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTNNAL1Q9UBT7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CTNNAL1Q9UBT7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTNNAL1Q9UBT7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTNNAL1Q9UBT7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTNNAL1Q9UBT7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTNNAL1Q9UBT7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTNNAL1Q9UBT7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTNNAL1Q9UBT7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTNNAL1Q9UBT7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTNNAL1Q9UBT7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTNNAL1Q9UBT7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTNNAL1Q9UBT7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTNNAL1Q9UBT7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTNNAL1Q9UBT7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTNNAL1Q9UBT7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTNNAL1Q9UBT7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTNNAL1Q9UBT7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTNNAL1Q9UBT7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTNNAL1Q9UBT7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTNNAL1Q9UBT7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTNNAL1Q9UBT7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTNNAL1Q9UBT7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTNNAL1Q9UBT7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTNNAL1Q9UBT7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTNNAL1Q9UBT7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTNNAL1Q9UBT7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTNNAL1Q9UBT7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTNNAL1Q9UBT7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CTNNAL1Q9UBT7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CTNNAL1Q9UBT7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTNNAL1Q9UBT7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTNNAL1Q9UBT7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTNNAL1Q9UBT7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTNNAL1Q9UBT7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTNNAL1Q9UBT7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTNNAL1Q9UBT7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTNNAL1Q9UBT7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms