Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN6

TNFRSF10D, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10D, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF10DQ9UBN6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF10DQ9UBN6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF10DQ9UBN6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF10DQ9UBN6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF10DQ9UBN6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF10DQ9UBN6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF10DQ9UBN6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF10DQ9UBN6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF10DQ9UBN6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF10DQ9UBN6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF10DQ9UBN6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF10DQ9UBN6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFRSF10DQ9UBN6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF10DQ9UBN6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF10DQ9UBN6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF10DQ9UBN6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF10DQ9UBN6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF10DQ9UBN6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFRSF10DQ9UBN6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF10DQ9UBN6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF10DQ9UBN6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF10DQ9UBN6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF10DQ9UBN6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF10DQ9UBN6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF10DQ9UBN6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF10DQ9UBN6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFRSF10DQ9UBN6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF10DQ9UBN6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF10DQ9UBN6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF10DQ9UBN6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF10DQ9UBN6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF10DQ9UBN6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF10DQ9UBN6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF10DQ9UBN6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF10DQ9UBN6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFRSF10DQ9UBN6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFRSF10DQ9UBN6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFRSF10DQ9UBN6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFRSF10DQ9UBN6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFRSF10DQ9UBN6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFRSF10DQ9UBN6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFRSF10DQ9UBN6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFRSF10DQ9UBN6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFRSF10DQ9UBN6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF10DQ9UBN6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF10DQ9UBN6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF10DQ9UBN6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF10DQ9UBN6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF10DQ9UBN6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF10DQ9UBN6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF10DQ9UBN6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF10DQ9UBN6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFRSF10DQ9UBN6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF10DQ9UBN6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF10DQ9UBN6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF10DQ9UBN6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF10DQ9UBN6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF10DQ9UBN6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFRSF10DQ9UBN6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFRSF10DQ9UBN6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFRSF10DQ9UBN6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFRSF10DQ9UBN6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFRSF10DQ9UBN6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFRSF10DQ9UBN6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFRSF10DQ9UBN6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFRSF10DQ9UBN6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFRSF10DQ9UBN6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFRSF10DQ9UBN6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFRSF10DQ9UBN6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFRSF10DQ9UBN6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFRSF10DQ9UBN6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFRSF10DQ9UBN6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFRSF10DQ9UBN6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFRSF10DQ9UBN6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFRSF10DQ9UBN6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFRSF10DQ9UBN6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFRSF10DQ9UBN6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFRSF10DQ9UBN6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFRSF10DQ9UBN6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFRSF10DQ9UBN6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFRSF10DQ9UBN6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFRSF10DQ9UBN6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFRSF10DQ9UBN6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFRSF10DQ9UBN6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFRSF10DQ9UBN6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFRSF10DQ9UBN6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFRSF10DQ9UBN6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFRSF10DQ9UBN6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFRSF10DQ9UBN6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFRSF10DQ9UBN6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFRSF10DQ9UBN6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF10DQ9UBN6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF10DQ9UBN6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF10DQ9UBN6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF10DQ9UBN6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF10DQ9UBN6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF10DQ9UBN6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF10DQ9UBN6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF10DQ9UBN6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF10DQ9UBN6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms