Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRPC4Q9UBN4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRPC4Q9UBN4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRPC4Q9UBN4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRPC4Q9UBN4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRPC4Q9UBN4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRPC4Q9UBN4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRPC4Q9UBN4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRPC4Q9UBN4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRPC4Q9UBN4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRPC4Q9UBN4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRPC4Q9UBN4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRPC4Q9UBN4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRPC4Q9UBN4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRPC4Q9UBN4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRPC4Q9UBN4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TRPC4Q9UBN4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRPC4Q9UBN4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRPC4Q9UBN4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRPC4Q9UBN4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRPC4Q9UBN4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRPC4Q9UBN4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRPC4Q9UBN4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRPC4Q9UBN4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRPC4Q9UBN4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRPC4Q9UBN4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRPC4Q9UBN4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRPC4Q9UBN4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TRPC4Q9UBN4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRPC4Q9UBN4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRPC4Q9UBN4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRPC4Q9UBN4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRPC4Q9UBN4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRPC4Q9UBN4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRPC4Q9UBN4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRPC4Q9UBN4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRPC4Q9UBN4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRPC4Q9UBN4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRPC4Q9UBN4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRPC4Q9UBN4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRPC4Q9UBN4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRPC4Q9UBN4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRPC4Q9UBN4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRPC4Q9UBN4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRPC4Q9UBN4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TRPC4Q9UBN4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRPC4Q9UBN4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRPC4Q9UBN4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TRPC4Q9UBN4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRPC4Q9UBN4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRPC4Q9UBN4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TRPC4Q9UBN4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRPC4Q9UBN4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRPC4Q9UBN4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TRPC4Q9UBN4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRPC4Q9UBN4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TRPC4Q9UBN4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRPC4Q9UBN4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRPC4Q9UBN4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRPC4Q9UBN4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRPC4Q9UBN4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRPC4Q9UBN4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRPC4Q9UBN4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TRPC4Q9UBN4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TRPC4Q9UBN4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRPC4Q9UBN4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRPC4Q9UBN4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRPC4Q9UBN4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRPC4Q9UBN4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRPC4Q9UBN4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRPC4Q9UBN4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRPC4Q9UBN4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRPC4Q9UBN4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRPC4Q9UBN4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRPC4Q9UBN4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRPC4Q9UBN4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRPC4Q9UBN4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRPC4Q9UBN4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRPC4Q9UBN4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRPC4Q9UBN4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRPC4Q9UBN4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRPC4Q9UBN4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRPC4Q9UBN4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRPC4Q9UBN4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRPC4Q9UBN4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRPC4Q9UBN4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRPC4Q9UBN4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRPC4Q9UBN4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRPC4Q9UBN4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRPC4Q9UBN4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRPC4Q9UBN4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRPC4Q9UBN4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRPC4Q9UBN4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRPC4Q9UBN4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRPC4Q9UBN4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRPC4Q9UBN4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRPC4Q9UBN4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRPC4Q9UBN4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRPC4Q9UBN4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TRPC4Q9UBN4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms