Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBI1

COMMD3, COMM domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD3Q9UBI1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COMMD3Q9UBI1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COMMD3Q9UBI1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COMMD3Q9UBI1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
COMMD3Q9UBI1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COMMD3Q9UBI1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COMMD3Q9UBI1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COMMD3Q9UBI1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COMMD3Q9UBI1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COMMD3Q9UBI1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COMMD3Q9UBI1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COMMD3Q9UBI1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COMMD3Q9UBI1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COMMD3Q9UBI1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COMMD3Q9UBI1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COMMD3Q9UBI1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COMMD3Q9UBI1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COMMD3Q9UBI1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
COMMD3Q9UBI1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
COMMD3Q9UBI1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
COMMD3Q9UBI1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
COMMD3Q9UBI1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
COMMD3Q9UBI1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
COMMD3Q9UBI1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COMMD3Q9UBI1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COMMD3Q9UBI1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COMMD3Q9UBI1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COMMD3Q9UBI1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COMMD3Q9UBI1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COMMD3Q9UBI1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
COMMD3Q9UBI1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COMMD3Q9UBI1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COMMD3Q9UBI1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COMMD3Q9UBI1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COMMD3Q9UBI1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COMMD3Q9UBI1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COMMD3Q9UBI1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COMMD3Q9UBI1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COMMD3Q9UBI1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COMMD3Q9UBI1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COMMD3Q9UBI1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COMMD3Q9UBI1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COMMD3Q9UBI1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COMMD3Q9UBI1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COMMD3Q9UBI1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COMMD3Q9UBI1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COMMD3Q9UBI1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COMMD3Q9UBI1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COMMD3Q9UBI1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COMMD3Q9UBI1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COMMD3Q9UBI1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COMMD3Q9UBI1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COMMD3Q9UBI1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COMMD3Q9UBI1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COMMD3Q9UBI1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COMMD3Q9UBI1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COMMD3Q9UBI1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COMMD3Q9UBI1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COMMD3Q9UBI1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COMMD3Q9UBI1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COMMD3Q9UBI1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COMMD3Q9UBI1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COMMD3Q9UBI1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COMMD3Q9UBI1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
COMMD3Q9UBI1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
COMMD3Q9UBI1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
COMMD3Q9UBI1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COMMD3Q9UBI1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COMMD3Q9UBI1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COMMD3Q9UBI1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COMMD3Q9UBI1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COMMD3Q9UBI1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COMMD3Q9UBI1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COMMD3Q9UBI1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COMMD3Q9UBI1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COMMD3Q9UBI1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COMMD3Q9UBI1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COMMD3Q9UBI1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COMMD3Q9UBI1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COMMD3Q9UBI1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COMMD3Q9UBI1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COMMD3Q9UBI1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
COMMD3Q9UBI1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COMMD3Q9UBI1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COMMD3Q9UBI1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COMMD3Q9UBI1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COMMD3Q9UBI1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COMMD3Q9UBI1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COMMD3Q9UBI1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COMMD3Q9UBI1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COMMD3Q9UBI1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COMMD3Q9UBI1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COMMD3Q9UBI1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COMMD3Q9UBI1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COMMD3Q9UBI1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
COMMD3Q9UBI1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COMMD3Q9UBI1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COMMD3Q9UBI1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COMMD3Q9UBI1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COMMD3Q9UBI1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
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