Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCMF1Q9P0J7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCMF1Q9P0J7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCMF1Q9P0J7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCMF1Q9P0J7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCMF1Q9P0J7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCMF1Q9P0J7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCMF1Q9P0J7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KCMF1Q9P0J7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCMF1Q9P0J7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCMF1Q9P0J7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCMF1Q9P0J7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KCMF1Q9P0J7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCMF1Q9P0J7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCMF1Q9P0J7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCMF1Q9P0J7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCMF1Q9P0J7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCMF1Q9P0J7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCMF1Q9P0J7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCMF1Q9P0J7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCMF1Q9P0J7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCMF1Q9P0J7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCMF1Q9P0J7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KCMF1Q9P0J7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KCMF1Q9P0J7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCMF1Q9P0J7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCMF1Q9P0J7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
KCMF1Q9P0J7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCMF1Q9P0J7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCMF1Q9P0J7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCMF1Q9P0J7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCMF1Q9P0J7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCMF1Q9P0J7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCMF1Q9P0J7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCMF1Q9P0J7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCMF1Q9P0J7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCMF1Q9P0J7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCMF1Q9P0J7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCMF1Q9P0J7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCMF1Q9P0J7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCMF1Q9P0J7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCMF1Q9P0J7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCMF1Q9P0J7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCMF1Q9P0J7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCMF1Q9P0J7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCMF1Q9P0J7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KCMF1Q9P0J7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCMF1Q9P0J7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCMF1Q9P0J7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCMF1Q9P0J7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KCMF1Q9P0J7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCMF1Q9P0J7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCMF1Q9P0J7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCMF1Q9P0J7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCMF1Q9P0J7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCMF1Q9P0J7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCMF1Q9P0J7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCMF1Q9P0J7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCMF1Q9P0J7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCMF1Q9P0J7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCMF1Q9P0J7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KCMF1Q9P0J7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCMF1Q9P0J7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCMF1Q9P0J7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCMF1Q9P0J7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCMF1Q9P0J7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KCMF1Q9P0J7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCMF1Q9P0J7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCMF1Q9P0J7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCMF1Q9P0J7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCMF1Q9P0J7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCMF1Q9P0J7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCMF1Q9P0J7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCMF1Q9P0J7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCMF1Q9P0J7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KCMF1Q9P0J7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KCMF1Q9P0J7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCMF1Q9P0J7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCMF1Q9P0J7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCMF1Q9P0J7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCMF1Q9P0J7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCMF1Q9P0J7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCMF1Q9P0J7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCMF1Q9P0J7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCMF1Q9P0J7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCMF1Q9P0J7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCMF1Q9P0J7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCMF1Q9P0J7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KCMF1Q9P0J7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCMF1Q9P0J7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCMF1Q9P0J7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCMF1Q9P0J7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCMF1Q9P0J7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCMF1Q9P0J7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCMF1Q9P0J7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCMF1Q9P0J7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCMF1Q9P0J7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCMF1Q9P0J7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KCMF1Q9P0J7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCMF1Q9P0J7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms