Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN8

CNOT2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT2Q9NZN8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNOT2Q9NZN8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNOT2Q9NZN8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNOT2Q9NZN8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNOT2Q9NZN8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNOT2Q9NZN8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNOT2Q9NZN8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNOT2Q9NZN8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CNOT2Q9NZN8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNOT2Q9NZN8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNOT2Q9NZN8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNOT2Q9NZN8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CNOT2Q9NZN8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNOT2Q9NZN8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNOT2Q9NZN8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNOT2Q9NZN8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNOT2Q9NZN8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNOT2Q9NZN8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNOT2Q9NZN8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNOT2Q9NZN8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNOT2Q9NZN8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNOT2Q9NZN8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNOT2Q9NZN8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNOT2Q9NZN8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNOT2Q9NZN8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNOT2Q9NZN8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNOT2Q9NZN8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNOT2Q9NZN8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNOT2Q9NZN8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNOT2Q9NZN8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNOT2Q9NZN8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNOT2Q9NZN8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNOT2Q9NZN8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNOT2Q9NZN8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNOT2Q9NZN8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNOT2Q9NZN8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNOT2Q9NZN8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNOT2Q9NZN8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNOT2Q9NZN8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNOT2Q9NZN8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNOT2Q9NZN8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNOT2Q9NZN8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNOT2Q9NZN8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNOT2Q9NZN8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNOT2Q9NZN8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNOT2Q9NZN8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNOT2Q9NZN8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNOT2Q9NZN8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNOT2Q9NZN8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNOT2Q9NZN8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNOT2Q9NZN8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNOT2Q9NZN8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNOT2Q9NZN8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNOT2Q9NZN8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNOT2Q9NZN8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNOT2Q9NZN8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNOT2Q9NZN8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNOT2Q9NZN8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CNOT2Q9NZN8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNOT2Q9NZN8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNOT2Q9NZN8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNOT2Q9NZN8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNOT2Q9NZN8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
CNOT2Q9NZN8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CNOT2Q9NZN8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNOT2Q9NZN8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNOT2Q9NZN8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNOT2Q9NZN8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNOT2Q9NZN8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNOT2Q9NZN8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNOT2Q9NZN8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNOT2Q9NZN8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNOT2Q9NZN8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNOT2Q9NZN8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNOT2Q9NZN8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNOT2Q9NZN8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNOT2Q9NZN8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNOT2Q9NZN8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNOT2Q9NZN8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNOT2Q9NZN8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNOT2Q9NZN8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNOT2Q9NZN8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNOT2Q9NZN8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNOT2Q9NZN8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CNOT2Q9NZN8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNOT2Q9NZN8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNOT2Q9NZN8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNOT2Q9NZN8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNOT2Q9NZN8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNOT2Q9NZN8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNOT2Q9NZN8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNOT2Q9NZN8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNOT2Q9NZN8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNOT2Q9NZN8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNOT2Q9NZN8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNOT2Q9NZN8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CNOT2Q9NZN8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNOT2Q9NZN8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNOT2Q9NZN8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNOT2Q9NZN8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.5 ms