Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY91

SLC5A4, Solute carrier family 5 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A4Q9NY91 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC5A4Q9NY91 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC5A4Q9NY91 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC5A4Q9NY91 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC5A4Q9NY91 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC5A4Q9NY91 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC5A4Q9NY91 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC5A4Q9NY91 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC5A4Q9NY91 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC5A4Q9NY91 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC5A4Q9NY91 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC5A4Q9NY91 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC5A4Q9NY91 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC5A4Q9NY91 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC5A4Q9NY91 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC5A4Q9NY91 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC5A4Q9NY91 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC5A4Q9NY91 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC5A4Q9NY91 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC5A4Q9NY91 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC5A4Q9NY91 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC5A4Q9NY91 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC5A4Q9NY91 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC5A4Q9NY91 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC5A4Q9NY91 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC5A4Q9NY91 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC5A4Q9NY91 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC5A4Q9NY91 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC5A4Q9NY91 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC5A4Q9NY91 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC5A4Q9NY91 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC5A4Q9NY91 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC5A4Q9NY91 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC5A4Q9NY91 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC5A4Q9NY91 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC5A4Q9NY91 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC5A4Q9NY91 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC5A4Q9NY91 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC5A4Q9NY91 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC5A4Q9NY91 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC5A4Q9NY91 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC5A4Q9NY91 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC5A4Q9NY91 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SLC5A4Q9NY91 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SLC5A4Q9NY91 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SLC5A4Q9NY91 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC5A4Q9NY91 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC5A4Q9NY91 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC5A4Q9NY91 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC5A4Q9NY91 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC5A4Q9NY91 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC5A4Q9NY91 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC5A4Q9NY91 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC5A4Q9NY91 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC5A4Q9NY91 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC5A4Q9NY91 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC5A4Q9NY91 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC5A4Q9NY91 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC5A4Q9NY91 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC5A4Q9NY91 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC5A4Q9NY91 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC5A4Q9NY91 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC5A4Q9NY91 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC5A4Q9NY91 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC5A4Q9NY91 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC5A4Q9NY91 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC5A4Q9NY91 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC5A4Q9NY91 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC5A4Q9NY91 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC5A4Q9NY91 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC5A4Q9NY91 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC5A4Q9NY91 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC5A4Q9NY91 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC5A4Q9NY91 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC5A4Q9NY91 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC5A4Q9NY91 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC5A4Q9NY91 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC5A4Q9NY91 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC5A4Q9NY91 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
SLC5A4Q9NY91 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC5A4Q9NY91 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SLC5A4Q9NY91 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC5A4Q9NY91 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SLC5A4Q9NY91 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC5A4Q9NY91 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC5A4Q9NY91 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SLC5A4Q9NY91 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SLC5A4Q9NY91 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SLC5A4Q9NY91 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SLC5A4Q9NY91 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SLC5A4Q9NY91 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC5A4Q9NY91 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC5A4Q9NY91 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC5A4Q9NY91 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC5A4Q9NY91 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC5A4Q9NY91 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
SLC5A4Q9NY91 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SLC5A4Q9NY91 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SLC5A4Q9NY91 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC5A4Q9NY91 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms