Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLN6Q9NWW5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLN6Q9NWW5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLN6Q9NWW5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLN6Q9NWW5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLN6Q9NWW5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLN6Q9NWW5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLN6Q9NWW5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLN6Q9NWW5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLN6Q9NWW5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLN6Q9NWW5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLN6Q9NWW5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLN6Q9NWW5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLN6Q9NWW5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLN6Q9NWW5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLN6Q9NWW5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLN6Q9NWW5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLN6Q9NWW5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLN6Q9NWW5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLN6Q9NWW5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLN6Q9NWW5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLN6Q9NWW5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLN6Q9NWW5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLN6Q9NWW5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLN6Q9NWW5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLN6Q9NWW5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLN6Q9NWW5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLN6Q9NWW5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLN6Q9NWW5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLN6Q9NWW5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLN6Q9NWW5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLN6Q9NWW5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLN6Q9NWW5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLN6Q9NWW5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLN6Q9NWW5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLN6Q9NWW5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLN6Q9NWW5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLN6Q9NWW5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLN6Q9NWW5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLN6Q9NWW5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLN6Q9NWW5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CLN6Q9NWW5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLN6Q9NWW5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLN6Q9NWW5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLN6Q9NWW5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLN6Q9NWW5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLN6Q9NWW5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLN6Q9NWW5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLN6Q9NWW5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLN6Q9NWW5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLN6Q9NWW5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLN6Q9NWW5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLN6Q9NWW5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLN6Q9NWW5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLN6Q9NWW5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLN6Q9NWW5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLN6Q9NWW5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CLN6Q9NWW5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLN6Q9NWW5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLN6Q9NWW5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLN6Q9NWW5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLN6Q9NWW5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLN6Q9NWW5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLN6Q9NWW5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CLN6Q9NWW5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLN6Q9NWW5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLN6Q9NWW5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLN6Q9NWW5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLN6Q9NWW5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLN6Q9NWW5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLN6Q9NWW5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLN6Q9NWW5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLN6Q9NWW5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLN6Q9NWW5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLN6Q9NWW5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLN6Q9NWW5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLN6Q9NWW5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLN6Q9NWW5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLN6Q9NWW5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLN6Q9NWW5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLN6Q9NWW5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLN6Q9NWW5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLN6Q9NWW5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLN6Q9NWW5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLN6Q9NWW5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLN6Q9NWW5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLN6Q9NWW5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLN6Q9NWW5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLN6Q9NWW5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLN6Q9NWW5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLN6Q9NWW5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLN6Q9NWW5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLN6Q9NWW5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLN6Q9NWW5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLN6Q9NWW5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLN6Q9NWW5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLN6Q9NWW5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLN6Q9NWW5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLN6Q9NWW5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLN6Q9NWW5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms