Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ASF1BQ9NVP2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ASF1BQ9NVP2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ASF1BQ9NVP2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ASF1BQ9NVP2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ASF1BQ9NVP2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ASF1BQ9NVP2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ASF1BQ9NVP2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ASF1BQ9NVP2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ASF1BQ9NVP2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ASF1BQ9NVP2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASF1BQ9NVP2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASF1BQ9NVP2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASF1BQ9NVP2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASF1BQ9NVP2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASF1BQ9NVP2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASF1BQ9NVP2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASF1BQ9NVP2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASF1BQ9NVP2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASF1BQ9NVP2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ASF1BQ9NVP2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ASF1BQ9NVP2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ASF1BQ9NVP2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ASF1BQ9NVP2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ASF1BQ9NVP2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ASF1BQ9NVP2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ASF1BQ9NVP2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ASF1BQ9NVP2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ASF1BQ9NVP2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
ASF1BQ9NVP2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ASF1BQ9NVP2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ASF1BQ9NVP2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ASF1BQ9NVP2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ASF1BQ9NVP2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ASF1BQ9NVP2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ASF1BQ9NVP2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ASF1BQ9NVP2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASF1BQ9NVP2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASF1BQ9NVP2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASF1BQ9NVP2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASF1BQ9NVP2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASF1BQ9NVP2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASF1BQ9NVP2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASF1BQ9NVP2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASF1BQ9NVP2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASF1BQ9NVP2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASF1BQ9NVP2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASF1BQ9NVP2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASF1BQ9NVP2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASF1BQ9NVP2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASF1BQ9NVP2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASF1BQ9NVP2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASF1BQ9NVP2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASF1BQ9NVP2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ASF1BQ9NVP2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ASF1BQ9NVP2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ASF1BQ9NVP2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ASF1BQ9NVP2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ASF1BQ9NVP2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ASF1BQ9NVP2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ASF1BQ9NVP2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ASF1BQ9NVP2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ASF1BQ9NVP2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ASF1BQ9NVP2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASF1BQ9NVP2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASF1BQ9NVP2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASF1BQ9NVP2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASF1BQ9NVP2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASF1BQ9NVP2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASF1BQ9NVP2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ASF1BQ9NVP2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ASF1BQ9NVP2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ASF1BQ9NVP2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ASF1BQ9NVP2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ASF1BQ9NVP2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ASF1BQ9NVP2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ASF1BQ9NVP2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ASF1BQ9NVP2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ASF1BQ9NVP2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ASF1BQ9NVP2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ASF1BQ9NVP2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ASF1BQ9NVP2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ASF1BQ9NVP2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ASF1BQ9NVP2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ASF1BQ9NVP2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ASF1BQ9NVP2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ASF1BQ9NVP2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ASF1BQ9NVP2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ASF1BQ9NVP2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ASF1BQ9NVP2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ASF1BQ9NVP2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ASF1BQ9NVP2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ASF1BQ9NVP2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ASF1BQ9NVP2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ASF1BQ9NVP2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ASF1BQ9NVP2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ASF1BQ9NVP2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ASF1BQ9NVP2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ASF1BQ9NVP2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ASF1BQ9NVP2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms