Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATAD3AQ9NVI7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATAD3AQ9NVI7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATAD3AQ9NVI7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATAD3AQ9NVI7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ATAD3AQ9NVI7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATAD3AQ9NVI7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATAD3AQ9NVI7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATAD3AQ9NVI7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATAD3AQ9NVI7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATAD3AQ9NVI7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATAD3AQ9NVI7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATAD3AQ9NVI7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATAD3AQ9NVI7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATAD3AQ9NVI7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATAD3AQ9NVI7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATAD3AQ9NVI7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATAD3AQ9NVI7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATAD3AQ9NVI7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ATAD3AQ9NVI7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATAD3AQ9NVI7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATAD3AQ9NVI7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ATAD3AQ9NVI7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATAD3AQ9NVI7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATAD3AQ9NVI7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATAD3AQ9NVI7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATAD3AQ9NVI7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATAD3AQ9NVI7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATAD3AQ9NVI7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATAD3AQ9NVI7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATAD3AQ9NVI7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATAD3AQ9NVI7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATAD3AQ9NVI7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATAD3AQ9NVI7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATAD3AQ9NVI7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATAD3AQ9NVI7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATAD3AQ9NVI7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATAD3AQ9NVI7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATAD3AQ9NVI7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATAD3AQ9NVI7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATAD3AQ9NVI7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATAD3AQ9NVI7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATAD3AQ9NVI7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATAD3AQ9NVI7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATAD3AQ9NVI7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATAD3AQ9NVI7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATAD3AQ9NVI7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATAD3AQ9NVI7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATAD3AQ9NVI7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATAD3AQ9NVI7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATAD3AQ9NVI7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATAD3AQ9NVI7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATAD3AQ9NVI7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATAD3AQ9NVI7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATAD3AQ9NVI7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATAD3AQ9NVI7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATAD3AQ9NVI7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATAD3AQ9NVI7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATAD3AQ9NVI7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ATAD3AQ9NVI7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATAD3AQ9NVI7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATAD3AQ9NVI7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATAD3AQ9NVI7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATAD3AQ9NVI7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATAD3AQ9NVI7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATAD3AQ9NVI7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATAD3AQ9NVI7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATAD3AQ9NVI7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATAD3AQ9NVI7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATAD3AQ9NVI7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATAD3AQ9NVI7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATAD3AQ9NVI7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATAD3AQ9NVI7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATAD3AQ9NVI7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATAD3AQ9NVI7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATAD3AQ9NVI7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATAD3AQ9NVI7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATAD3AQ9NVI7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATAD3AQ9NVI7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATAD3AQ9NVI7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATAD3AQ9NVI7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ATAD3AQ9NVI7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATAD3AQ9NVI7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATAD3AQ9NVI7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATAD3AQ9NVI7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATAD3AQ9NVI7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATAD3AQ9NVI7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATAD3AQ9NVI7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATAD3AQ9NVI7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATAD3AQ9NVI7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATAD3AQ9NVI7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATAD3AQ9NVI7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATAD3AQ9NVI7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATAD3AQ9NVI7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATAD3AQ9NVI7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATAD3AQ9NVI7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ATAD3AQ9NVI7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATAD3AQ9NVI7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATAD3AQ9NVI7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATAD3AQ9NVI7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85 ms