Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV79

PCMTD2, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD2Q9NV79 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCMTD2Q9NV79 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCMTD2Q9NV79 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCMTD2Q9NV79 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCMTD2Q9NV79 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCMTD2Q9NV79 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PCMTD2Q9NV79 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCMTD2Q9NV79 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCMTD2Q9NV79 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCMTD2Q9NV79 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCMTD2Q9NV79 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PCMTD2Q9NV79 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PCMTD2Q9NV79 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCMTD2Q9NV79 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCMTD2Q9NV79 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCMTD2Q9NV79 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCMTD2Q9NV79 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCMTD2Q9NV79 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCMTD2Q9NV79 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCMTD2Q9NV79 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCMTD2Q9NV79 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCMTD2Q9NV79 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCMTD2Q9NV79 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCMTD2Q9NV79 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCMTD2Q9NV79 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCMTD2Q9NV79 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCMTD2Q9NV79 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCMTD2Q9NV79 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCMTD2Q9NV79 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCMTD2Q9NV79 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCMTD2Q9NV79 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCMTD2Q9NV79 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCMTD2Q9NV79 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCMTD2Q9NV79 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCMTD2Q9NV79 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCMTD2Q9NV79 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCMTD2Q9NV79 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCMTD2Q9NV79 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCMTD2Q9NV79 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCMTD2Q9NV79 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCMTD2Q9NV79 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCMTD2Q9NV79 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCMTD2Q9NV79 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCMTD2Q9NV79 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCMTD2Q9NV79 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCMTD2Q9NV79 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCMTD2Q9NV79 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCMTD2Q9NV79 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCMTD2Q9NV79 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.47
PCMTD2Q9NV79 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCMTD2Q9NV79 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCMTD2Q9NV79 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCMTD2Q9NV79 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCMTD2Q9NV79 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCMTD2Q9NV79 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCMTD2Q9NV79 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCMTD2Q9NV79 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PCMTD2Q9NV79 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCMTD2Q9NV79 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCMTD2Q9NV79 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCMTD2Q9NV79 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCMTD2Q9NV79 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCMTD2Q9NV79 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCMTD2Q9NV79 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCMTD2Q9NV79 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCMTD2Q9NV79 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCMTD2Q9NV79 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCMTD2Q9NV79 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCMTD2Q9NV79 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCMTD2Q9NV79 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCMTD2Q9NV79 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCMTD2Q9NV79 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCMTD2Q9NV79 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCMTD2Q9NV79 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCMTD2Q9NV79 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCMTD2Q9NV79 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCMTD2Q9NV79 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCMTD2Q9NV79 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCMTD2Q9NV79 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCMTD2Q9NV79 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCMTD2Q9NV79 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCMTD2Q9NV79 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCMTD2Q9NV79 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCMTD2Q9NV79 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PCMTD2Q9NV79 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PCMTD2Q9NV79 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCMTD2Q9NV79 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCMTD2Q9NV79 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCMTD2Q9NV79 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCMTD2Q9NV79 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCMTD2Q9NV79 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCMTD2Q9NV79 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCMTD2Q9NV79 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCMTD2Q9NV79 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCMTD2Q9NV79 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCMTD2Q9NV79 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCMTD2Q9NV79 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCMTD2Q9NV79 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCMTD2Q9NV79 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCMTD2Q9NV79 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms