Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUK0

MBNL3, Muscleblind-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBNL3Q9NUK0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MBNL3Q9NUK0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MBNL3Q9NUK0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MBNL3Q9NUK0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MBNL3Q9NUK0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MBNL3Q9NUK0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MBNL3Q9NUK0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MBNL3Q9NUK0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MBNL3Q9NUK0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MBNL3Q9NUK0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MBNL3Q9NUK0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MBNL3Q9NUK0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MBNL3Q9NUK0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MBNL3Q9NUK0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MBNL3Q9NUK0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MBNL3Q9NUK0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MBNL3Q9NUK0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MBNL3Q9NUK0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MBNL3Q9NUK0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MBNL3Q9NUK0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MBNL3Q9NUK0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MBNL3Q9NUK0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MBNL3Q9NUK0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MBNL3Q9NUK0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MBNL3Q9NUK0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MBNL3Q9NUK0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MBNL3Q9NUK0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MBNL3Q9NUK0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MBNL3Q9NUK0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MBNL3Q9NUK0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MBNL3Q9NUK0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MBNL3Q9NUK0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MBNL3Q9NUK0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MBNL3Q9NUK0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MBNL3Q9NUK0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MBNL3Q9NUK0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MBNL3Q9NUK0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MBNL3Q9NUK0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MBNL3Q9NUK0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MBNL3Q9NUK0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MBNL3Q9NUK0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MBNL3Q9NUK0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MBNL3Q9NUK0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
MBNL3Q9NUK0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MBNL3Q9NUK0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MBNL3Q9NUK0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MBNL3Q9NUK0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MBNL3Q9NUK0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MBNL3Q9NUK0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MBNL3Q9NUK0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MBNL3Q9NUK0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MBNL3Q9NUK0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
MBNL3Q9NUK0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MBNL3Q9NUK0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MBNL3Q9NUK0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
MBNL3Q9NUK0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MBNL3Q9NUK0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MBNL3Q9NUK0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MBNL3Q9NUK0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MBNL3Q9NUK0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MBNL3Q9NUK0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MBNL3Q9NUK0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MBNL3Q9NUK0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MBNL3Q9NUK0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MBNL3Q9NUK0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MBNL3Q9NUK0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MBNL3Q9NUK0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MBNL3Q9NUK0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MBNL3Q9NUK0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MBNL3Q9NUK0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20■□□□□ 0.79
MBNL3Q9NUK0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MBNL3Q9NUK0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MBNL3Q9NUK0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MBNL3Q9NUK0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MBNL3Q9NUK0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MBNL3Q9NUK0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MBNL3Q9NUK0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MBNL3Q9NUK0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MBNL3Q9NUK0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MBNL3Q9NUK0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MBNL3Q9NUK0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MBNL3Q9NUK0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
MBNL3Q9NUK0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
MBNL3Q9NUK0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MBNL3Q9NUK0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MBNL3Q9NUK0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MBNL3Q9NUK0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MBNL3Q9NUK0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
MBNL3Q9NUK0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MBNL3Q9NUK0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MBNL3Q9NUK0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MBNL3Q9NUK0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MBNL3Q9NUK0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MBNL3Q9NUK0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MBNL3Q9NUK0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MBNL3Q9NUK0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MBNL3Q9NUK0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
MBNL3Q9NUK0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MBNL3Q9NUK0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MBNL3Q9NUK0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms