Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI5

PDS5B, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDS5BQ9NTI5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
PDS5BQ9NTI5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC42.55■■■■■ 4.4
PDS5BQ9NTI5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC42.55■■■■■ 4.4
PDS5BQ9NTI5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
PDS5BQ9NTI5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
PDS5BQ9NTI5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC42.55■■■■■ 4.4
PDS5BQ9NTI5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
PDS5BQ9NTI5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC42.54■■■■■ 4.4
PDS5BQ9NTI5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC42.54■■■■■ 4.4
PDS5BQ9NTI5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
PDS5BQ9NTI5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC42.53■■■■■ 4.4
PDS5BQ9NTI5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC42.53■■■■■ 4.4
PDS5BQ9NTI5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
PDS5BQ9NTI5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC42.51■■■■■ 4.4
PDS5BQ9NTI5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
PDS5BQ9NTI5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
PDS5BQ9NTI5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC42.5■■■■■ 4.39
PDS5BQ9NTI5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
PDS5BQ9NTI5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
PDS5BQ9NTI5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
PDS5BQ9NTI5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
PDS5BQ9NTI5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
PDS5BQ9NTI5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC42.48■■■■■ 4.39
PDS5BQ9NTI5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
PDS5BQ9NTI5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
PDS5BQ9NTI5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC42.47■■■■■ 4.39
PDS5BQ9NTI5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC42.47■■■■■ 4.39
PDS5BQ9NTI5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
PDS5BQ9NTI5 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC42.47■■■■■ 4.39
PDS5BQ9NTI5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.47■■■■■ 4.39
PDS5BQ9NTI5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC42.46■■■■■ 4.39
PDS5BQ9NTI5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC42.46■■■■■ 4.39
PDS5BQ9NTI5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.46■■■■■ 4.39
PDS5BQ9NTI5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC42.45■■■■■ 4.39
PDS5BQ9NTI5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
PDS5BQ9NTI5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
PDS5BQ9NTI5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
PDS5BQ9NTI5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC42.44■■■■■ 4.38
PDS5BQ9NTI5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC42.44■■■■■ 4.38
PDS5BQ9NTI5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC42.44■■■■■ 4.38
PDS5BQ9NTI5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC42.44■■■■■ 4.38
PDS5BQ9NTI5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC42.44■■■■■ 4.38
PDS5BQ9NTI5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
PDS5BQ9NTI5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC42.42■■■■■ 4.38
PDS5BQ9NTI5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
PDS5BQ9NTI5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC42.4■■■■■ 4.38
PDS5BQ9NTI5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC42.4■■■■■ 4.38
PDS5BQ9NTI5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC42.4■■■■■ 4.38
PDS5BQ9NTI5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
PDS5BQ9NTI5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
PDS5BQ9NTI5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC42.38■■■■■ 4.38
PDS5BQ9NTI5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC42.38■■■■■ 4.37
PDS5BQ9NTI5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.38■■■■■ 4.37
PDS5BQ9NTI5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC42.37■■■■■ 4.37
PDS5BQ9NTI5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
PDS5BQ9NTI5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
PDS5BQ9NTI5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC42.36■■■■■ 4.37
PDS5BQ9NTI5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC42.36■■■■■ 4.37
PDS5BQ9NTI5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
PDS5BQ9NTI5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC42.35■■■■■ 4.37
PDS5BQ9NTI5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC42.35■■■■■ 4.37
PDS5BQ9NTI5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
PDS5BQ9NTI5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
PDS5BQ9NTI5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
PDS5BQ9NTI5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
PDS5BQ9NTI5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
PDS5BQ9NTI5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC42.34■■■■■ 4.37
PDS5BQ9NTI5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC42.34■■■■■ 4.37
PDS5BQ9NTI5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC42.34■■■■■ 4.37
PDS5BQ9NTI5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC42.34■■■■■ 4.37
PDS5BQ9NTI5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
PDS5BQ9NTI5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
PDS5BQ9NTI5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.33■■■■■ 4.37
PDS5BQ9NTI5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
PDS5BQ9NTI5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.33■■■■■ 4.37
PDS5BQ9NTI5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
PDS5BQ9NTI5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
PDS5BQ9NTI5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
PDS5BQ9NTI5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC42.3■■■■■ 4.36
PDS5BQ9NTI5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC42.3■■■■■ 4.36
PDS5BQ9NTI5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
PDS5BQ9NTI5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
PDS5BQ9NTI5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.29■■■■■ 4.36
PDS5BQ9NTI5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC42.29■■■■■ 4.36
PDS5BQ9NTI5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
PDS5BQ9NTI5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC42.29■■■■■ 4.36
PDS5BQ9NTI5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC42.28■■■■■ 4.36
PDS5BQ9NTI5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
PDS5BQ9NTI5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC42.27■■■■■ 4.36
PDS5BQ9NTI5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
PDS5BQ9NTI5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC42.27■■■■■ 4.36
PDS5BQ9NTI5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC42.26■■■■■ 4.36
PDS5BQ9NTI5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.25■■■■■ 4.35
PDS5BQ9NTI5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC42.24■■■■■ 4.35
PDS5BQ9NTI5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC42.23■■■■■ 4.35
PDS5BQ9NTI5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
PDS5BQ9NTI5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
PDS5BQ9NTI5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC42.22■■■■■ 4.35
PDS5BQ9NTI5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC42.21■■■■■ 4.35
PDS5BQ9NTI5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC42.21■■■■■ 4.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms