Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNBIP1Q9NSA3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNBIP1Q9NSA3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTNNBIP1Q9NSA3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNBIP1Q9NSA3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTNNBIP1Q9NSA3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNBIP1Q9NSA3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNBIP1Q9NSA3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNBIP1Q9NSA3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNBIP1Q9NSA3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNBIP1Q9NSA3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNBIP1Q9NSA3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTNNBIP1Q9NSA3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTNNBIP1Q9NSA3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTNNBIP1Q9NSA3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTNNBIP1Q9NSA3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTNNBIP1Q9NSA3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTNNBIP1Q9NSA3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTNNBIP1Q9NSA3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTNNBIP1Q9NSA3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTNNBIP1Q9NSA3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTNNBIP1Q9NSA3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTNNBIP1Q9NSA3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTNNBIP1Q9NSA3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTNNBIP1Q9NSA3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTNNBIP1Q9NSA3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTNNBIP1Q9NSA3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTNNBIP1Q9NSA3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTNNBIP1Q9NSA3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTNNBIP1Q9NSA3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTNNBIP1Q9NSA3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTNNBIP1Q9NSA3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CTNNBIP1Q9NSA3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTNNBIP1Q9NSA3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTNNBIP1Q9NSA3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTNNBIP1Q9NSA3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTNNBIP1Q9NSA3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTNNBIP1Q9NSA3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTNNBIP1Q9NSA3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CTNNBIP1Q9NSA3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTNNBIP1Q9NSA3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTNNBIP1Q9NSA3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTNNBIP1Q9NSA3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTNNBIP1Q9NSA3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTNNBIP1Q9NSA3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTNNBIP1Q9NSA3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTNNBIP1Q9NSA3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CTNNBIP1Q9NSA3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTNNBIP1Q9NSA3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTNNBIP1Q9NSA3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTNNBIP1Q9NSA3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTNNBIP1Q9NSA3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTNNBIP1Q9NSA3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTNNBIP1Q9NSA3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTNNBIP1Q9NSA3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTNNBIP1Q9NSA3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTNNBIP1Q9NSA3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTNNBIP1Q9NSA3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTNNBIP1Q9NSA3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CTNNBIP1Q9NSA3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CTNNBIP1Q9NSA3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CTNNBIP1Q9NSA3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CTNNBIP1Q9NSA3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CTNNBIP1Q9NSA3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CTNNBIP1Q9NSA3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CTNNBIP1Q9NSA3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CTNNBIP1Q9NSA3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CTNNBIP1Q9NSA3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTNNBIP1Q9NSA3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTNNBIP1Q9NSA3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTNNBIP1Q9NSA3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTNNBIP1Q9NSA3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTNNBIP1Q9NSA3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTNNBIP1Q9NSA3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CTNNBIP1Q9NSA3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTNNBIP1Q9NSA3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTNNBIP1Q9NSA3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTNNBIP1Q9NSA3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTNNBIP1Q9NSA3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CTNNBIP1Q9NSA3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTNNBIP1Q9NSA3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTNNBIP1Q9NSA3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTNNBIP1Q9NSA3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTNNBIP1Q9NSA3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CTNNBIP1Q9NSA3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTNNBIP1Q9NSA3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTNNBIP1Q9NSA3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms