Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS23

RASSF1, Ras association domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF1Q9NS23 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RASSF1Q9NS23 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RASSF1Q9NS23 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RASSF1Q9NS23 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RASSF1Q9NS23 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RASSF1Q9NS23 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RASSF1Q9NS23 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RASSF1Q9NS23 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RASSF1Q9NS23 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RASSF1Q9NS23 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RASSF1Q9NS23 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RASSF1Q9NS23 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RASSF1Q9NS23 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RASSF1Q9NS23 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RASSF1Q9NS23 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RASSF1Q9NS23 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RASSF1Q9NS23 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RASSF1Q9NS23 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RASSF1Q9NS23 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RASSF1Q9NS23 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RASSF1Q9NS23 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RASSF1Q9NS23 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RASSF1Q9NS23 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RASSF1Q9NS23 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RASSF1Q9NS23 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RASSF1Q9NS23 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RASSF1Q9NS23 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RASSF1Q9NS23 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RASSF1Q9NS23 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RASSF1Q9NS23 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RASSF1Q9NS23 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RASSF1Q9NS23 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RASSF1Q9NS23 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RASSF1Q9NS23 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RASSF1Q9NS23 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RASSF1Q9NS23 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RASSF1Q9NS23 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RASSF1Q9NS23 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RASSF1Q9NS23 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RASSF1Q9NS23 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RASSF1Q9NS23 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RASSF1Q9NS23 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RASSF1Q9NS23 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RASSF1Q9NS23 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RASSF1Q9NS23 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RASSF1Q9NS23 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RASSF1Q9NS23 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RASSF1Q9NS23 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RASSF1Q9NS23 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RASSF1Q9NS23 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RASSF1Q9NS23 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RASSF1Q9NS23 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RASSF1Q9NS23 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RASSF1Q9NS23 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RASSF1Q9NS23 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RASSF1Q9NS23 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RASSF1Q9NS23 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RASSF1Q9NS23 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RASSF1Q9NS23 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RASSF1Q9NS23 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RASSF1Q9NS23 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RASSF1Q9NS23 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RASSF1Q9NS23 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RASSF1Q9NS23 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RASSF1Q9NS23 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RASSF1Q9NS23 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RASSF1Q9NS23 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RASSF1Q9NS23 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RASSF1Q9NS23 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RASSF1Q9NS23 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RASSF1Q9NS23 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RASSF1Q9NS23 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RASSF1Q9NS23 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RASSF1Q9NS23 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RASSF1Q9NS23 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RASSF1Q9NS23 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RASSF1Q9NS23 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RASSF1Q9NS23 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RASSF1Q9NS23 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RASSF1Q9NS23 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RASSF1Q9NS23 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RASSF1Q9NS23 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RASSF1Q9NS23 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RASSF1Q9NS23 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RASSF1Q9NS23 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RASSF1Q9NS23 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RASSF1Q9NS23 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RASSF1Q9NS23 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RASSF1Q9NS23 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RASSF1Q9NS23 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RASSF1Q9NS23 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RASSF1Q9NS23 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RASSF1Q9NS23 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RASSF1Q9NS23 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RASSF1Q9NS23 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RASSF1Q9NS23 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RASSF1Q9NS23 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RASSF1Q9NS23 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RASSF1Q9NS23 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RASSF1Q9NS23 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms