Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS00

C1GALT1, Glycoprotein-N-acetylgalactosamine 3-beta-galactosyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1GALT1Q9NS00 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1GALT1Q9NS00 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1GALT1Q9NS00 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1GALT1Q9NS00 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1GALT1Q9NS00 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1GALT1Q9NS00 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1GALT1Q9NS00 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1GALT1Q9NS00 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1GALT1Q9NS00 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1GALT1Q9NS00 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1GALT1Q9NS00 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1GALT1Q9NS00 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1GALT1Q9NS00 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1GALT1Q9NS00 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1GALT1Q9NS00 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1GALT1Q9NS00 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1GALT1Q9NS00 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1GALT1Q9NS00 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1GALT1Q9NS00 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1GALT1Q9NS00 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1GALT1Q9NS00 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
C1GALT1Q9NS00 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1GALT1Q9NS00 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1GALT1Q9NS00 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1GALT1Q9NS00 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1GALT1Q9NS00 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1GALT1Q9NS00 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1GALT1Q9NS00 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1GALT1Q9NS00 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1GALT1Q9NS00 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1GALT1Q9NS00 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1GALT1Q9NS00 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1GALT1Q9NS00 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1GALT1Q9NS00 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1GALT1Q9NS00 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1GALT1Q9NS00 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1GALT1Q9NS00 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1GALT1Q9NS00 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1GALT1Q9NS00 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
C1GALT1Q9NS00 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1GALT1Q9NS00 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1GALT1Q9NS00 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1GALT1Q9NS00 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1GALT1Q9NS00 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1GALT1Q9NS00 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1GALT1Q9NS00 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1GALT1Q9NS00 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1GALT1Q9NS00 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
C1GALT1Q9NS00 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
C1GALT1Q9NS00 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C1GALT1Q9NS00 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
C1GALT1Q9NS00 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
C1GALT1Q9NS00 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C1GALT1Q9NS00 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C1GALT1Q9NS00 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
C1GALT1Q9NS00 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C1GALT1Q9NS00 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C1GALT1Q9NS00 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C1GALT1Q9NS00 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1GALT1Q9NS00 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1GALT1Q9NS00 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
C1GALT1Q9NS00 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1GALT1Q9NS00 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1GALT1Q9NS00 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1GALT1Q9NS00 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1GALT1Q9NS00 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1GALT1Q9NS00 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1GALT1Q9NS00 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1GALT1Q9NS00 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1GALT1Q9NS00 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1GALT1Q9NS00 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1GALT1Q9NS00 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1GALT1Q9NS00 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1GALT1Q9NS00 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1GALT1Q9NS00 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1GALT1Q9NS00 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1GALT1Q9NS00 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1GALT1Q9NS00 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1GALT1Q9NS00 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1GALT1Q9NS00 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1GALT1Q9NS00 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
C1GALT1Q9NS00 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1GALT1Q9NS00 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1GALT1Q9NS00 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1GALT1Q9NS00 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1GALT1Q9NS00 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1GALT1Q9NS00 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1GALT1Q9NS00 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C1GALT1Q9NS00 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C1GALT1Q9NS00 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C1GALT1Q9NS00 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C1GALT1Q9NS00 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C1GALT1Q9NS00 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1GALT1Q9NS00 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1GALT1Q9NS00 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1GALT1Q9NS00 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1GALT1Q9NS00 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1GALT1Q9NS00 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1GALT1Q9NS00 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1GALT1Q9NS00 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms