Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF9

POLE3, DNA polymerase epsilon subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE3Q9NRF9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLE3Q9NRF9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLE3Q9NRF9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLE3Q9NRF9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
POLE3Q9NRF9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLE3Q9NRF9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLE3Q9NRF9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLE3Q9NRF9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLE3Q9NRF9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
POLE3Q9NRF9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
POLE3Q9NRF9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLE3Q9NRF9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLE3Q9NRF9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLE3Q9NRF9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLE3Q9NRF9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLE3Q9NRF9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLE3Q9NRF9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLE3Q9NRF9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLE3Q9NRF9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLE3Q9NRF9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLE3Q9NRF9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLE3Q9NRF9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLE3Q9NRF9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLE3Q9NRF9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
POLE3Q9NRF9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLE3Q9NRF9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLE3Q9NRF9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLE3Q9NRF9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLE3Q9NRF9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLE3Q9NRF9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLE3Q9NRF9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLE3Q9NRF9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLE3Q9NRF9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
POLE3Q9NRF9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
POLE3Q9NRF9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLE3Q9NRF9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLE3Q9NRF9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLE3Q9NRF9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLE3Q9NRF9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
POLE3Q9NRF9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLE3Q9NRF9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLE3Q9NRF9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLE3Q9NRF9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
POLE3Q9NRF9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLE3Q9NRF9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLE3Q9NRF9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLE3Q9NRF9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLE3Q9NRF9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLE3Q9NRF9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLE3Q9NRF9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLE3Q9NRF9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLE3Q9NRF9 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLE3Q9NRF9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLE3Q9NRF9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLE3Q9NRF9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
POLE3Q9NRF9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
POLE3Q9NRF9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
POLE3Q9NRF9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLE3Q9NRF9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLE3Q9NRF9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLE3Q9NRF9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLE3Q9NRF9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLE3Q9NRF9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLE3Q9NRF9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLE3Q9NRF9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLE3Q9NRF9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLE3Q9NRF9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLE3Q9NRF9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLE3Q9NRF9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLE3Q9NRF9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLE3Q9NRF9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLE3Q9NRF9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLE3Q9NRF9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLE3Q9NRF9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLE3Q9NRF9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLE3Q9NRF9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLE3Q9NRF9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLE3Q9NRF9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLE3Q9NRF9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLE3Q9NRF9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLE3Q9NRF9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLE3Q9NRF9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLE3Q9NRF9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLE3Q9NRF9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLE3Q9NRF9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLE3Q9NRF9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLE3Q9NRF9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLE3Q9NRF9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLE3Q9NRF9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLE3Q9NRF9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLE3Q9NRF9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLE3Q9NRF9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLE3Q9NRF9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
POLE3Q9NRF9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLE3Q9NRF9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLE3Q9NRF9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLE3Q9NRF9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLE3Q9NRF9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLE3Q9NRF9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLE3Q9NRF9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms