Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR50

EIF2B3, Translation initiation factor eIF-2B subunit gamma, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF2B3Q9NR50 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EIF2B3Q9NR50 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EIF2B3Q9NR50 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
EIF2B3Q9NR50 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EIF2B3Q9NR50 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EIF2B3Q9NR50 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EIF2B3Q9NR50 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EIF2B3Q9NR50 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EIF2B3Q9NR50 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EIF2B3Q9NR50 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EIF2B3Q9NR50 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EIF2B3Q9NR50 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EIF2B3Q9NR50 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
EIF2B3Q9NR50 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EIF2B3Q9NR50 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EIF2B3Q9NR50 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EIF2B3Q9NR50 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EIF2B3Q9NR50 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EIF2B3Q9NR50 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EIF2B3Q9NR50 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EIF2B3Q9NR50 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EIF2B3Q9NR50 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EIF2B3Q9NR50 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EIF2B3Q9NR50 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EIF2B3Q9NR50 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EIF2B3Q9NR50 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EIF2B3Q9NR50 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EIF2B3Q9NR50 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EIF2B3Q9NR50 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EIF2B3Q9NR50 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
EIF2B3Q9NR50 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EIF2B3Q9NR50 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EIF2B3Q9NR50 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EIF2B3Q9NR50 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EIF2B3Q9NR50 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EIF2B3Q9NR50 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EIF2B3Q9NR50 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EIF2B3Q9NR50 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
EIF2B3Q9NR50 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EIF2B3Q9NR50 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EIF2B3Q9NR50 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EIF2B3Q9NR50 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EIF2B3Q9NR50 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EIF2B3Q9NR50 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EIF2B3Q9NR50 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EIF2B3Q9NR50 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EIF2B3Q9NR50 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EIF2B3Q9NR50 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EIF2B3Q9NR50 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EIF2B3Q9NR50 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EIF2B3Q9NR50 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
EIF2B3Q9NR50 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EIF2B3Q9NR50 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
EIF2B3Q9NR50 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EIF2B3Q9NR50 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EIF2B3Q9NR50 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EIF2B3Q9NR50 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EIF2B3Q9NR50 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EIF2B3Q9NR50 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EIF2B3Q9NR50 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EIF2B3Q9NR50 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
EIF2B3Q9NR50 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EIF2B3Q9NR50 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EIF2B3Q9NR50 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EIF2B3Q9NR50 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EIF2B3Q9NR50 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EIF2B3Q9NR50 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
EIF2B3Q9NR50 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EIF2B3Q9NR50 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EIF2B3Q9NR50 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EIF2B3Q9NR50 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EIF2B3Q9NR50 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EIF2B3Q9NR50 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EIF2B3Q9NR50 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EIF2B3Q9NR50 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EIF2B3Q9NR50 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EIF2B3Q9NR50 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EIF2B3Q9NR50 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EIF2B3Q9NR50 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EIF2B3Q9NR50 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EIF2B3Q9NR50 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EIF2B3Q9NR50 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EIF2B3Q9NR50 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EIF2B3Q9NR50 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
EIF2B3Q9NR50 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EIF2B3Q9NR50 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EIF2B3Q9NR50 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EIF2B3Q9NR50 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EIF2B3Q9NR50 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
EIF2B3Q9NR50 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EIF2B3Q9NR50 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EIF2B3Q9NR50 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EIF2B3Q9NR50 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EIF2B3Q9NR50 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EIF2B3Q9NR50 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EIF2B3Q9NR50 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EIF2B3Q9NR50 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EIF2B3Q9NR50 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EIF2B3Q9NR50 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EIF2B3Q9NR50 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms