Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC2

KCNK9, Potassium channel subfamily K member 9, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK9Q9NPC2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNK9Q9NPC2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNK9Q9NPC2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNK9Q9NPC2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNK9Q9NPC2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNK9Q9NPC2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNK9Q9NPC2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNK9Q9NPC2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNK9Q9NPC2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNK9Q9NPC2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNK9Q9NPC2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNK9Q9NPC2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNK9Q9NPC2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNK9Q9NPC2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNK9Q9NPC2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNK9Q9NPC2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNK9Q9NPC2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNK9Q9NPC2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNK9Q9NPC2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNK9Q9NPC2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNK9Q9NPC2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNK9Q9NPC2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNK9Q9NPC2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNK9Q9NPC2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNK9Q9NPC2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNK9Q9NPC2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNK9Q9NPC2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNK9Q9NPC2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNK9Q9NPC2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNK9Q9NPC2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNK9Q9NPC2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNK9Q9NPC2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNK9Q9NPC2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNK9Q9NPC2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNK9Q9NPC2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNK9Q9NPC2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNK9Q9NPC2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNK9Q9NPC2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNK9Q9NPC2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNK9Q9NPC2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNK9Q9NPC2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNK9Q9NPC2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNK9Q9NPC2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNK9Q9NPC2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNK9Q9NPC2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNK9Q9NPC2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNK9Q9NPC2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNK9Q9NPC2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNK9Q9NPC2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNK9Q9NPC2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNK9Q9NPC2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNK9Q9NPC2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNK9Q9NPC2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNK9Q9NPC2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNK9Q9NPC2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNK9Q9NPC2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNK9Q9NPC2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNK9Q9NPC2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNK9Q9NPC2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNK9Q9NPC2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNK9Q9NPC2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNK9Q9NPC2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNK9Q9NPC2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNK9Q9NPC2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNK9Q9NPC2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNK9Q9NPC2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNK9Q9NPC2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNK9Q9NPC2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNK9Q9NPC2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNK9Q9NPC2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNK9Q9NPC2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNK9Q9NPC2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNK9Q9NPC2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNK9Q9NPC2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNK9Q9NPC2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNK9Q9NPC2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNK9Q9NPC2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNK9Q9NPC2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNK9Q9NPC2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNK9Q9NPC2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNK9Q9NPC2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNK9Q9NPC2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNK9Q9NPC2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNK9Q9NPC2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNK9Q9NPC2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNK9Q9NPC2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNK9Q9NPC2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNK9Q9NPC2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNK9Q9NPC2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNK9Q9NPC2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNK9Q9NPC2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNK9Q9NPC2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNK9Q9NPC2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNK9Q9NPC2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNK9Q9NPC2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNK9Q9NPC2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNK9Q9NPC2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNK9Q9NPC2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNK9Q9NPC2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNK9Q9NPC2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.5 ms