Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCN3

TMEM8A, Post-GPI attachment to proteins factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM8AQ9HCN3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM8AQ9HCN3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM8AQ9HCN3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM8AQ9HCN3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM8AQ9HCN3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM8AQ9HCN3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM8AQ9HCN3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM8AQ9HCN3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
TMEM8AQ9HCN3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TMEM8AQ9HCN3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMEM8AQ9HCN3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMEM8AQ9HCN3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMEM8AQ9HCN3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMEM8AQ9HCN3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMEM8AQ9HCN3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM8AQ9HCN3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM8AQ9HCN3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM8AQ9HCN3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM8AQ9HCN3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM8AQ9HCN3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM8AQ9HCN3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM8AQ9HCN3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM8AQ9HCN3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM8AQ9HCN3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM8AQ9HCN3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM8AQ9HCN3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM8AQ9HCN3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM8AQ9HCN3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM8AQ9HCN3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM8AQ9HCN3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM8AQ9HCN3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM8AQ9HCN3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM8AQ9HCN3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM8AQ9HCN3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM8AQ9HCN3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM8AQ9HCN3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM8AQ9HCN3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM8AQ9HCN3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM8AQ9HCN3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM8AQ9HCN3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM8AQ9HCN3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM8AQ9HCN3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM8AQ9HCN3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM8AQ9HCN3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM8AQ9HCN3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM8AQ9HCN3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM8AQ9HCN3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TMEM8AQ9HCN3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TMEM8AQ9HCN3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM8AQ9HCN3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM8AQ9HCN3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM8AQ9HCN3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM8AQ9HCN3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM8AQ9HCN3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM8AQ9HCN3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM8AQ9HCN3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM8AQ9HCN3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM8AQ9HCN3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM8AQ9HCN3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM8AQ9HCN3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM8AQ9HCN3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM8AQ9HCN3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM8AQ9HCN3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM8AQ9HCN3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM8AQ9HCN3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM8AQ9HCN3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM8AQ9HCN3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM8AQ9HCN3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM8AQ9HCN3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM8AQ9HCN3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM8AQ9HCN3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM8AQ9HCN3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM8AQ9HCN3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM8AQ9HCN3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM8AQ9HCN3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM8AQ9HCN3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM8AQ9HCN3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM8AQ9HCN3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM8AQ9HCN3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM8AQ9HCN3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM8AQ9HCN3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM8AQ9HCN3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM8AQ9HCN3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM8AQ9HCN3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM8AQ9HCN3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM8AQ9HCN3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM8AQ9HCN3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM8AQ9HCN3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM8AQ9HCN3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM8AQ9HCN3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM8AQ9HCN3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM8AQ9HCN3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM8AQ9HCN3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM8AQ9HCN3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM8AQ9HCN3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM8AQ9HCN3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM8AQ9HCN3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM8AQ9HCN3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM8AQ9HCN3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM8AQ9HCN3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms