Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC98

NEK6, Serine/threonine-protein kinase Nek6, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK6Q9HC98 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEK6Q9HC98 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEK6Q9HC98 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEK6Q9HC98 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEK6Q9HC98 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEK6Q9HC98 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEK6Q9HC98 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NEK6Q9HC98 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEK6Q9HC98 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEK6Q9HC98 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEK6Q9HC98 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEK6Q9HC98 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NEK6Q9HC98 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEK6Q9HC98 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEK6Q9HC98 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEK6Q9HC98 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEK6Q9HC98 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEK6Q9HC98 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEK6Q9HC98 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEK6Q9HC98 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEK6Q9HC98 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEK6Q9HC98 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEK6Q9HC98 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEK6Q9HC98 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEK6Q9HC98 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEK6Q9HC98 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEK6Q9HC98 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEK6Q9HC98 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEK6Q9HC98 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NEK6Q9HC98 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEK6Q9HC98 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEK6Q9HC98 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEK6Q9HC98 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEK6Q9HC98 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEK6Q9HC98 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEK6Q9HC98 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEK6Q9HC98 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEK6Q9HC98 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEK6Q9HC98 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEK6Q9HC98 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEK6Q9HC98 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEK6Q9HC98 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEK6Q9HC98 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEK6Q9HC98 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEK6Q9HC98 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEK6Q9HC98 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEK6Q9HC98 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEK6Q9HC98 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEK6Q9HC98 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEK6Q9HC98 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEK6Q9HC98 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEK6Q9HC98 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEK6Q9HC98 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEK6Q9HC98 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEK6Q9HC98 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEK6Q9HC98 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEK6Q9HC98 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEK6Q9HC98 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEK6Q9HC98 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEK6Q9HC98 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEK6Q9HC98 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEK6Q9HC98 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEK6Q9HC98 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEK6Q9HC98 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEK6Q9HC98 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEK6Q9HC98 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEK6Q9HC98 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEK6Q9HC98 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEK6Q9HC98 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEK6Q9HC98 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEK6Q9HC98 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEK6Q9HC98 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEK6Q9HC98 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEK6Q9HC98 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEK6Q9HC98 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEK6Q9HC98 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEK6Q9HC98 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEK6Q9HC98 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEK6Q9HC98 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEK6Q9HC98 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEK6Q9HC98 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEK6Q9HC98 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEK6Q9HC98 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEK6Q9HC98 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEK6Q9HC98 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEK6Q9HC98 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEK6Q9HC98 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEK6Q9HC98 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEK6Q9HC98 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEK6Q9HC98 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEK6Q9HC98 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NEK6Q9HC98 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEK6Q9HC98 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEK6Q9HC98 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NEK6Q9HC98 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NEK6Q9HC98 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEK6Q9HC98 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
NEK6Q9HC98 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEK6Q9HC98 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEK6Q9HC98 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.8 ms