Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CLSPNQ9HAW4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CLSPNQ9HAW4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CLSPNQ9HAW4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
CLSPNQ9HAW4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
CLSPNQ9HAW4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
CLSPNQ9HAW4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CLSPNQ9HAW4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
CLSPNQ9HAW4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CLSPNQ9HAW4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CLSPNQ9HAW4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
CLSPNQ9HAW4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
CLSPNQ9HAW4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CLSPNQ9HAW4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CLSPNQ9HAW4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CLSPNQ9HAW4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
CLSPNQ9HAW4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
CLSPNQ9HAW4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
CLSPNQ9HAW4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CLSPNQ9HAW4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
CLSPNQ9HAW4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CLSPNQ9HAW4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CLSPNQ9HAW4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC35.43■■■■□ 3.26
CLSPNQ9HAW4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
CLSPNQ9HAW4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
CLSPNQ9HAW4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
CLSPNQ9HAW4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
CLSPNQ9HAW4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
CLSPNQ9HAW4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
CLSPNQ9HAW4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
CLSPNQ9HAW4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
CLSPNQ9HAW4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
CLSPNQ9HAW4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
CLSPNQ9HAW4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
CLSPNQ9HAW4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
CLSPNQ9HAW4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
CLSPNQ9HAW4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
CLSPNQ9HAW4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
CLSPNQ9HAW4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CLSPNQ9HAW4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CLSPNQ9HAW4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CLSPNQ9HAW4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CLSPNQ9HAW4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CLSPNQ9HAW4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CLSPNQ9HAW4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
CLSPNQ9HAW4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CLSPNQ9HAW4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
CLSPNQ9HAW4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CLSPNQ9HAW4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
CLSPNQ9HAW4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
CLSPNQ9HAW4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC35.37■■■■□ 3.25
CLSPNQ9HAW4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
CLSPNQ9HAW4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
CLSPNQ9HAW4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
CLSPNQ9HAW4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CLSPNQ9HAW4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CLSPNQ9HAW4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CLSPNQ9HAW4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
CLSPNQ9HAW4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
CLSPNQ9HAW4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
CLSPNQ9HAW4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
CLSPNQ9HAW4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
CLSPNQ9HAW4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
CLSPNQ9HAW4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CLSPNQ9HAW4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CLSPNQ9HAW4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
CLSPNQ9HAW4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
CLSPNQ9HAW4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
CLSPNQ9HAW4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CLSPNQ9HAW4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CLSPNQ9HAW4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
CLSPNQ9HAW4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
CLSPNQ9HAW4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
CLSPNQ9HAW4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
CLSPNQ9HAW4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
CLSPNQ9HAW4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
CLSPNQ9HAW4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
CLSPNQ9HAW4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
CLSPNQ9HAW4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
CLSPNQ9HAW4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
CLSPNQ9HAW4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
CLSPNQ9HAW4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
CLSPNQ9HAW4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
CLSPNQ9HAW4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
CLSPNQ9HAW4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
CLSPNQ9HAW4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CLSPNQ9HAW4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
CLSPNQ9HAW4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
CLSPNQ9HAW4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
CLSPNQ9HAW4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
CLSPNQ9HAW4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
CLSPNQ9HAW4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
CLSPNQ9HAW4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
CLSPNQ9HAW4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CLSPNQ9HAW4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
CLSPNQ9HAW4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CLSPNQ9HAW4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
CLSPNQ9HAW4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CLSPNQ9HAW4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
CLSPNQ9HAW4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms