Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Y6

POLR1B, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1BQ9H9Y6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR1BQ9H9Y6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR1BQ9H9Y6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR1BQ9H9Y6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR1BQ9H9Y6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR1BQ9H9Y6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR1BQ9H9Y6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR1BQ9H9Y6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR1BQ9H9Y6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR1BQ9H9Y6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR1BQ9H9Y6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR1BQ9H9Y6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR1BQ9H9Y6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR1BQ9H9Y6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR1BQ9H9Y6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR1BQ9H9Y6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR1BQ9H9Y6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR1BQ9H9Y6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR1BQ9H9Y6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR1BQ9H9Y6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR1BQ9H9Y6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR1BQ9H9Y6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR1BQ9H9Y6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR1BQ9H9Y6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR1BQ9H9Y6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR1BQ9H9Y6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR1BQ9H9Y6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR1BQ9H9Y6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR1BQ9H9Y6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR1BQ9H9Y6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR1BQ9H9Y6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR1BQ9H9Y6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR1BQ9H9Y6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR1BQ9H9Y6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR1BQ9H9Y6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR1BQ9H9Y6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR1BQ9H9Y6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR1BQ9H9Y6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR1BQ9H9Y6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR1BQ9H9Y6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR1BQ9H9Y6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR1BQ9H9Y6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR1BQ9H9Y6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR1BQ9H9Y6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR1BQ9H9Y6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR1BQ9H9Y6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR1BQ9H9Y6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR1BQ9H9Y6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR1BQ9H9Y6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR1BQ9H9Y6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR1BQ9H9Y6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR1BQ9H9Y6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR1BQ9H9Y6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR1BQ9H9Y6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR1BQ9H9Y6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR1BQ9H9Y6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR1BQ9H9Y6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR1BQ9H9Y6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR1BQ9H9Y6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR1BQ9H9Y6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR1BQ9H9Y6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR1BQ9H9Y6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR1BQ9H9Y6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR1BQ9H9Y6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR1BQ9H9Y6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR1BQ9H9Y6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR1BQ9H9Y6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR1BQ9H9Y6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR1BQ9H9Y6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
POLR1BQ9H9Y6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
POLR1BQ9H9Y6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
POLR1BQ9H9Y6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
POLR1BQ9H9Y6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
POLR1BQ9H9Y6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR1BQ9H9Y6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR1BQ9H9Y6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR1BQ9H9Y6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR1BQ9H9Y6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR1BQ9H9Y6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR1BQ9H9Y6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR1BQ9H9Y6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR1BQ9H9Y6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR1BQ9H9Y6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR1BQ9H9Y6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR1BQ9H9Y6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR1BQ9H9Y6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR1BQ9H9Y6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR1BQ9H9Y6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR1BQ9H9Y6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR1BQ9H9Y6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR1BQ9H9Y6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR1BQ9H9Y6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR1BQ9H9Y6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR1BQ9H9Y6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR1BQ9H9Y6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR1BQ9H9Y6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR1BQ9H9Y6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR1BQ9H9Y6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR1BQ9H9Y6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR1BQ9H9Y6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms