Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Q2

COPS7B, COP9 signalosome complex subunit 7b, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7BQ9H9Q2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COPS7BQ9H9Q2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COPS7BQ9H9Q2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COPS7BQ9H9Q2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COPS7BQ9H9Q2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COPS7BQ9H9Q2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COPS7BQ9H9Q2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COPS7BQ9H9Q2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COPS7BQ9H9Q2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COPS7BQ9H9Q2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COPS7BQ9H9Q2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COPS7BQ9H9Q2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COPS7BQ9H9Q2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COPS7BQ9H9Q2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COPS7BQ9H9Q2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COPS7BQ9H9Q2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COPS7BQ9H9Q2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COPS7BQ9H9Q2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COPS7BQ9H9Q2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COPS7BQ9H9Q2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
COPS7BQ9H9Q2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COPS7BQ9H9Q2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COPS7BQ9H9Q2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COPS7BQ9H9Q2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COPS7BQ9H9Q2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COPS7BQ9H9Q2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COPS7BQ9H9Q2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COPS7BQ9H9Q2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COPS7BQ9H9Q2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COPS7BQ9H9Q2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COPS7BQ9H9Q2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COPS7BQ9H9Q2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COPS7BQ9H9Q2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COPS7BQ9H9Q2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COPS7BQ9H9Q2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COPS7BQ9H9Q2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COPS7BQ9H9Q2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COPS7BQ9H9Q2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COPS7BQ9H9Q2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COPS7BQ9H9Q2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COPS7BQ9H9Q2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPS7BQ9H9Q2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPS7BQ9H9Q2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPS7BQ9H9Q2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPS7BQ9H9Q2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPS7BQ9H9Q2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPS7BQ9H9Q2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPS7BQ9H9Q2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPS7BQ9H9Q2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPS7BQ9H9Q2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPS7BQ9H9Q2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPS7BQ9H9Q2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPS7BQ9H9Q2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
COPS7BQ9H9Q2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
COPS7BQ9H9Q2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPS7BQ9H9Q2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPS7BQ9H9Q2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPS7BQ9H9Q2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPS7BQ9H9Q2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPS7BQ9H9Q2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPS7BQ9H9Q2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPS7BQ9H9Q2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPS7BQ9H9Q2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPS7BQ9H9Q2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPS7BQ9H9Q2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPS7BQ9H9Q2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPS7BQ9H9Q2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPS7BQ9H9Q2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPS7BQ9H9Q2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPS7BQ9H9Q2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPS7BQ9H9Q2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPS7BQ9H9Q2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPS7BQ9H9Q2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPS7BQ9H9Q2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPS7BQ9H9Q2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPS7BQ9H9Q2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPS7BQ9H9Q2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPS7BQ9H9Q2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPS7BQ9H9Q2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
COPS7BQ9H9Q2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPS7BQ9H9Q2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPS7BQ9H9Q2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
COPS7BQ9H9Q2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
COPS7BQ9H9Q2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPS7BQ9H9Q2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPS7BQ9H9Q2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPS7BQ9H9Q2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPS7BQ9H9Q2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPS7BQ9H9Q2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COPS7BQ9H9Q2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
COPS7BQ9H9Q2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COPS7BQ9H9Q2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
COPS7BQ9H9Q2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
COPS7BQ9H9Q2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COPS7BQ9H9Q2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COPS7BQ9H9Q2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COPS7BQ9H9Q2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COPS7BQ9H9Q2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COPS7BQ9H9Q2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COPS7BQ9H9Q2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms