Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
C11orf49Q9H6J7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
C11orf49Q9H6J7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
C11orf49Q9H6J7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
C11orf49Q9H6J7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
C11orf49Q9H6J7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
C11orf49Q9H6J7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
C11orf49Q9H6J7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
C11orf49Q9H6J7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
C11orf49Q9H6J7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
C11orf49Q9H6J7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
C11orf49Q9H6J7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
C11orf49Q9H6J7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
C11orf49Q9H6J7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
C11orf49Q9H6J7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
C11orf49Q9H6J7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
C11orf49Q9H6J7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
C11orf49Q9H6J7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
C11orf49Q9H6J7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
C11orf49Q9H6J7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
C11orf49Q9H6J7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
C11orf49Q9H6J7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
C11orf49Q9H6J7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
C11orf49Q9H6J7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
C11orf49Q9H6J7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
C11orf49Q9H6J7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
C11orf49Q9H6J7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
C11orf49Q9H6J7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
C11orf49Q9H6J7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
C11orf49Q9H6J7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
C11orf49Q9H6J7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
C11orf49Q9H6J7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
C11orf49Q9H6J7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
C11orf49Q9H6J7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
C11orf49Q9H6J7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
C11orf49Q9H6J7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
C11orf49Q9H6J7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
C11orf49Q9H6J7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
C11orf49Q9H6J7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
C11orf49Q9H6J7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
C11orf49Q9H6J7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
C11orf49Q9H6J7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
C11orf49Q9H6J7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
C11orf49Q9H6J7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
C11orf49Q9H6J7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
C11orf49Q9H6J7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
C11orf49Q9H6J7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
C11orf49Q9H6J7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
C11orf49Q9H6J7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
C11orf49Q9H6J7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
C11orf49Q9H6J7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
C11orf49Q9H6J7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
C11orf49Q9H6J7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
C11orf49Q9H6J7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
C11orf49Q9H6J7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
C11orf49Q9H6J7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
C11orf49Q9H6J7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
C11orf49Q9H6J7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
C11orf49Q9H6J7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
C11orf49Q9H6J7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
C11orf49Q9H6J7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
C11orf49Q9H6J7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
C11orf49Q9H6J7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
C11orf49Q9H6J7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
C11orf49Q9H6J7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
C11orf49Q9H6J7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
C11orf49Q9H6J7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
C11orf49Q9H6J7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
C11orf49Q9H6J7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
C11orf49Q9H6J7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
C11orf49Q9H6J7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
C11orf49Q9H6J7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
C11orf49Q9H6J7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
C11orf49Q9H6J7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
C11orf49Q9H6J7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
C11orf49Q9H6J7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
C11orf49Q9H6J7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
C11orf49Q9H6J7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
C11orf49Q9H6J7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
C11orf49Q9H6J7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
C11orf49Q9H6J7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
C11orf49Q9H6J7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
C11orf49Q9H6J7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
C11orf49Q9H6J7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
C11orf49Q9H6J7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
C11orf49Q9H6J7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
C11orf49Q9H6J7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
C11orf49Q9H6J7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
C11orf49Q9H6J7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
C11orf49Q9H6J7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
C11orf49Q9H6J7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
C11orf49Q9H6J7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
C11orf49Q9H6J7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27■■□□□ 1.91
C11orf49Q9H6J7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
C11orf49Q9H6J7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
C11orf49Q9H6J7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
C11orf49Q9H6J7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
C11orf49Q9H6J7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
C11orf49Q9H6J7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
C11orf49Q9H6J7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms