Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6F2

TMEM38A, Trimeric intracellular cation channel type A, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM38AQ9H6F2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM38AQ9H6F2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM38AQ9H6F2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM38AQ9H6F2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM38AQ9H6F2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM38AQ9H6F2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM38AQ9H6F2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM38AQ9H6F2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM38AQ9H6F2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM38AQ9H6F2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM38AQ9H6F2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM38AQ9H6F2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM38AQ9H6F2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM38AQ9H6F2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM38AQ9H6F2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM38AQ9H6F2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM38AQ9H6F2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM38AQ9H6F2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM38AQ9H6F2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM38AQ9H6F2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM38AQ9H6F2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM38AQ9H6F2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM38AQ9H6F2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM38AQ9H6F2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM38AQ9H6F2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM38AQ9H6F2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM38AQ9H6F2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM38AQ9H6F2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM38AQ9H6F2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM38AQ9H6F2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM38AQ9H6F2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM38AQ9H6F2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM38AQ9H6F2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM38AQ9H6F2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM38AQ9H6F2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM38AQ9H6F2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM38AQ9H6F2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM38AQ9H6F2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM38AQ9H6F2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM38AQ9H6F2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM38AQ9H6F2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM38AQ9H6F2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM38AQ9H6F2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM38AQ9H6F2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM38AQ9H6F2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM38AQ9H6F2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM38AQ9H6F2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM38AQ9H6F2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM38AQ9H6F2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM38AQ9H6F2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM38AQ9H6F2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM38AQ9H6F2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM38AQ9H6F2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM38AQ9H6F2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM38AQ9H6F2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM38AQ9H6F2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM38AQ9H6F2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM38AQ9H6F2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM38AQ9H6F2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM38AQ9H6F2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM38AQ9H6F2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM38AQ9H6F2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM38AQ9H6F2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM38AQ9H6F2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM38AQ9H6F2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM38AQ9H6F2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM38AQ9H6F2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM38AQ9H6F2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM38AQ9H6F2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM38AQ9H6F2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM38AQ9H6F2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM38AQ9H6F2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM38AQ9H6F2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM38AQ9H6F2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM38AQ9H6F2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TMEM38AQ9H6F2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TMEM38AQ9H6F2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM38AQ9H6F2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM38AQ9H6F2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM38AQ9H6F2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM38AQ9H6F2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM38AQ9H6F2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM38AQ9H6F2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM38AQ9H6F2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM38AQ9H6F2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM38AQ9H6F2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM38AQ9H6F2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM38AQ9H6F2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM38AQ9H6F2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM38AQ9H6F2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM38AQ9H6F2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM38AQ9H6F2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM38AQ9H6F2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM38AQ9H6F2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM38AQ9H6F2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM38AQ9H6F2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM38AQ9H6F2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM38AQ9H6F2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM38AQ9H6F2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM38AQ9H6F2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms