Protein–RNA interactions for Protein: Q9H611

PIF1, ATP-dependent DNA helicase PIF1, humanhuman

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIF1Q9H611 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIF1Q9H611 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIF1Q9H611 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIF1Q9H611 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIF1Q9H611 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIF1Q9H611 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIF1Q9H611 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIF1Q9H611 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PIF1Q9H611 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PIF1Q9H611 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PIF1Q9H611 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PIF1Q9H611 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PIF1Q9H611 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PIF1Q9H611 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIF1Q9H611 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIF1Q9H611 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIF1Q9H611 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIF1Q9H611 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIF1Q9H611 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIF1Q9H611 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIF1Q9H611 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIF1Q9H611 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIF1Q9H611 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIF1Q9H611 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIF1Q9H611 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIF1Q9H611 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIF1Q9H611 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIF1Q9H611 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIF1Q9H611 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIF1Q9H611 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIF1Q9H611 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIF1Q9H611 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIF1Q9H611 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIF1Q9H611 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PIF1Q9H611 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PIF1Q9H611 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIF1Q9H611 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PIF1Q9H611 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIF1Q9H611 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIF1Q9H611 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIF1Q9H611 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIF1Q9H611 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIF1Q9H611 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIF1Q9H611 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIF1Q9H611 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIF1Q9H611 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIF1Q9H611 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIF1Q9H611 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIF1Q9H611 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIF1Q9H611 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIF1Q9H611 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIF1Q9H611 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIF1Q9H611 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIF1Q9H611 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIF1Q9H611 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PIF1Q9H611 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIF1Q9H611 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PIF1Q9H611 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PIF1Q9H611 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PIF1Q9H611 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIF1Q9H611 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIF1Q9H611 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIF1Q9H611 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PIF1Q9H611 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIF1Q9H611 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIF1Q9H611 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIF1Q9H611 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIF1Q9H611 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIF1Q9H611 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIF1Q9H611 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIF1Q9H611 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIF1Q9H611 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIF1Q9H611 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIF1Q9H611 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIF1Q9H611 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIF1Q9H611 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIF1Q9H611 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIF1Q9H611 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIF1Q9H611 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIF1Q9H611 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIF1Q9H611 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIF1Q9H611 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIF1Q9H611 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIF1Q9H611 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIF1Q9H611 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIF1Q9H611 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIF1Q9H611 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIF1Q9H611 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIF1Q9H611 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIF1Q9H611 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIF1Q9H611 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIF1Q9H611 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIF1Q9H611 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIF1Q9H611 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIF1Q9H611 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIF1Q9H611 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIF1Q9H611 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIF1Q9H611 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIF1Q9H611 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIF1Q9H611 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms