Protein–RNA interactions for Protein: Q9H446

RWDD1, RWD domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD1Q9H446 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
RWDD1Q9H446 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
RWDD1Q9H446 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.45
RWDD1Q9H446 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RWDD1Q9H446 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RWDD1Q9H446 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
RWDD1Q9H446 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RWDD1Q9H446 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RWDD1Q9H446 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
RWDD1Q9H446 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
RWDD1Q9H446 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RWDD1Q9H446 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RWDD1Q9H446 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RWDD1Q9H446 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RWDD1Q9H446 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RWDD1Q9H446 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RWDD1Q9H446 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
RWDD1Q9H446 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RWDD1Q9H446 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RWDD1Q9H446 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RWDD1Q9H446 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
RWDD1Q9H446 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
RWDD1Q9H446 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
RWDD1Q9H446 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RWDD1Q9H446 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
RWDD1Q9H446 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
RWDD1Q9H446 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RWDD1Q9H446 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RWDD1Q9H446 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RWDD1Q9H446 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RWDD1Q9H446 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RWDD1Q9H446 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RWDD1Q9H446 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RWDD1Q9H446 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RWDD1Q9H446 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RWDD1Q9H446 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
RWDD1Q9H446 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RWDD1Q9H446 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
RWDD1Q9H446 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
RWDD1Q9H446 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
RWDD1Q9H446 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
RWDD1Q9H446 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
RWDD1Q9H446 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
RWDD1Q9H446 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
RWDD1Q9H446 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RWDD1Q9H446 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RWDD1Q9H446 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RWDD1Q9H446 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RWDD1Q9H446 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RWDD1Q9H446 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RWDD1Q9H446 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RWDD1Q9H446 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RWDD1Q9H446 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RWDD1Q9H446 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
RWDD1Q9H446 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RWDD1Q9H446 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RWDD1Q9H446 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RWDD1Q9H446 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RWDD1Q9H446 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RWDD1Q9H446 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RWDD1Q9H446 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RWDD1Q9H446 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RWDD1Q9H446 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RWDD1Q9H446 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RWDD1Q9H446 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RWDD1Q9H446 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RWDD1Q9H446 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RWDD1Q9H446 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RWDD1Q9H446 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RWDD1Q9H446 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RWDD1Q9H446 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RWDD1Q9H446 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
RWDD1Q9H446 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
RWDD1Q9H446 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
RWDD1Q9H446 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
RWDD1Q9H446 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
RWDD1Q9H446 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
RWDD1Q9H446 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
RWDD1Q9H446 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RWDD1Q9H446 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RWDD1Q9H446 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RWDD1Q9H446 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
RWDD1Q9H446 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RWDD1Q9H446 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RWDD1Q9H446 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RWDD1Q9H446 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RWDD1Q9H446 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RWDD1Q9H446 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RWDD1Q9H446 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
RWDD1Q9H446 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RWDD1Q9H446 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RWDD1Q9H446 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RWDD1Q9H446 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RWDD1Q9H446 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RWDD1Q9H446 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RWDD1Q9H446 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RWDD1Q9H446 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RWDD1Q9H446 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RWDD1Q9H446 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RWDD1Q9H446 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms