Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2E6

SEMA6A, Semaphorin-6A, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6AQ9H2E6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA6AQ9H2E6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA6AQ9H2E6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA6AQ9H2E6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA6AQ9H2E6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA6AQ9H2E6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA6AQ9H2E6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA6AQ9H2E6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA6AQ9H2E6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA6AQ9H2E6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA6AQ9H2E6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA6AQ9H2E6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA6AQ9H2E6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA6AQ9H2E6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA6AQ9H2E6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA6AQ9H2E6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEMA6AQ9H2E6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA6AQ9H2E6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA6AQ9H2E6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA6AQ9H2E6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEMA6AQ9H2E6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA6AQ9H2E6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA6AQ9H2E6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA6AQ9H2E6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA6AQ9H2E6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA6AQ9H2E6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEMA6AQ9H2E6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA6AQ9H2E6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA6AQ9H2E6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA6AQ9H2E6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA6AQ9H2E6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA6AQ9H2E6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEMA6AQ9H2E6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEMA6AQ9H2E6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SEMA6AQ9H2E6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEMA6AQ9H2E6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SEMA6AQ9H2E6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SEMA6AQ9H2E6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEMA6AQ9H2E6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SEMA6AQ9H2E6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA6AQ9H2E6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA6AQ9H2E6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA6AQ9H2E6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA6AQ9H2E6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA6AQ9H2E6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEMA6AQ9H2E6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA6AQ9H2E6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA6AQ9H2E6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA6AQ9H2E6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA6AQ9H2E6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA6AQ9H2E6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA6AQ9H2E6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA6AQ9H2E6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA6AQ9H2E6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEMA6AQ9H2E6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA6AQ9H2E6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA6AQ9H2E6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA6AQ9H2E6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA6AQ9H2E6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA6AQ9H2E6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA6AQ9H2E6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA6AQ9H2E6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA6AQ9H2E6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA6AQ9H2E6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA6AQ9H2E6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA6AQ9H2E6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA6AQ9H2E6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA6AQ9H2E6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA6AQ9H2E6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA6AQ9H2E6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA6AQ9H2E6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA6AQ9H2E6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA6AQ9H2E6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA6AQ9H2E6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA6AQ9H2E6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA6AQ9H2E6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA6AQ9H2E6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA6AQ9H2E6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA6AQ9H2E6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA6AQ9H2E6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA6AQ9H2E6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA6AQ9H2E6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA6AQ9H2E6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA6AQ9H2E6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA6AQ9H2E6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA6AQ9H2E6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA6AQ9H2E6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SEMA6AQ9H2E6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SEMA6AQ9H2E6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SEMA6AQ9H2E6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SEMA6AQ9H2E6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA6AQ9H2E6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA6AQ9H2E6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA6AQ9H2E6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA6AQ9H2E6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA6AQ9H2E6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA6AQ9H2E6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA6AQ9H2E6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA6AQ9H2E6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA6AQ9H2E6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms