Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0R8

GABARAPL1, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL1Q9H0R8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABARAPL1Q9H0R8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABARAPL1Q9H0R8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABARAPL1Q9H0R8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
GABARAPL1Q9H0R8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABARAPL1Q9H0R8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABARAPL1Q9H0R8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABARAPL1Q9H0R8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABARAPL1Q9H0R8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABARAPL1Q9H0R8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABARAPL1Q9H0R8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABARAPL1Q9H0R8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABARAPL1Q9H0R8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GABARAPL1Q9H0R8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABARAPL1Q9H0R8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABARAPL1Q9H0R8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABARAPL1Q9H0R8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABARAPL1Q9H0R8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABARAPL1Q9H0R8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABARAPL1Q9H0R8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABARAPL1Q9H0R8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABARAPL1Q9H0R8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABARAPL1Q9H0R8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABARAPL1Q9H0R8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABARAPL1Q9H0R8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GABARAPL1Q9H0R8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABARAPL1Q9H0R8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABARAPL1Q9H0R8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABARAPL1Q9H0R8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABARAPL1Q9H0R8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABARAPL1Q9H0R8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GABARAPL1Q9H0R8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GABARAPL1Q9H0R8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABARAPL1Q9H0R8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABARAPL1Q9H0R8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABARAPL1Q9H0R8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABARAPL1Q9H0R8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABARAPL1Q9H0R8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABARAPL1Q9H0R8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABARAPL1Q9H0R8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABARAPL1Q9H0R8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABARAPL1Q9H0R8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABARAPL1Q9H0R8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABARAPL1Q9H0R8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GABARAPL1Q9H0R8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABARAPL1Q9H0R8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABARAPL1Q9H0R8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABARAPL1Q9H0R8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABARAPL1Q9H0R8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABARAPL1Q9H0R8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABARAPL1Q9H0R8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABARAPL1Q9H0R8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABARAPL1Q9H0R8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABARAPL1Q9H0R8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABARAPL1Q9H0R8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABARAPL1Q9H0R8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABARAPL1Q9H0R8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABARAPL1Q9H0R8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABARAPL1Q9H0R8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABARAPL1Q9H0R8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABARAPL1Q9H0R8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABARAPL1Q9H0R8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABARAPL1Q9H0R8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABARAPL1Q9H0R8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABARAPL1Q9H0R8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABARAPL1Q9H0R8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABARAPL1Q9H0R8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GABARAPL1Q9H0R8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABARAPL1Q9H0R8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABARAPL1Q9H0R8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABARAPL1Q9H0R8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABARAPL1Q9H0R8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABARAPL1Q9H0R8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABARAPL1Q9H0R8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABARAPL1Q9H0R8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABARAPL1Q9H0R8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABARAPL1Q9H0R8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GABARAPL1Q9H0R8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABARAPL1Q9H0R8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABARAPL1Q9H0R8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABARAPL1Q9H0R8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABARAPL1Q9H0R8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABARAPL1Q9H0R8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABARAPL1Q9H0R8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABARAPL1Q9H0R8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABARAPL1Q9H0R8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABARAPL1Q9H0R8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABARAPL1Q9H0R8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GABARAPL1Q9H0R8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GABARAPL1Q9H0R8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GABARAPL1Q9H0R8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABARAPL1Q9H0R8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABARAPL1Q9H0R8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABARAPL1Q9H0R8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABARAPL1Q9H0R8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABARAPL1Q9H0R8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABARAPL1Q9H0R8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABARAPL1Q9H0R8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABARAPL1Q9H0R8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GABARAPL1Q9H0R8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms