Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT8

NIF3L1, NIF3-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIF3L1Q9GZT8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NIF3L1Q9GZT8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NIF3L1Q9GZT8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NIF3L1Q9GZT8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NIF3L1Q9GZT8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NIF3L1Q9GZT8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NIF3L1Q9GZT8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NIF3L1Q9GZT8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NIF3L1Q9GZT8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NIF3L1Q9GZT8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NIF3L1Q9GZT8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NIF3L1Q9GZT8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NIF3L1Q9GZT8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NIF3L1Q9GZT8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NIF3L1Q9GZT8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NIF3L1Q9GZT8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NIF3L1Q9GZT8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NIF3L1Q9GZT8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NIF3L1Q9GZT8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NIF3L1Q9GZT8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NIF3L1Q9GZT8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NIF3L1Q9GZT8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NIF3L1Q9GZT8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NIF3L1Q9GZT8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
NIF3L1Q9GZT8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NIF3L1Q9GZT8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NIF3L1Q9GZT8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NIF3L1Q9GZT8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NIF3L1Q9GZT8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NIF3L1Q9GZT8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NIF3L1Q9GZT8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NIF3L1Q9GZT8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NIF3L1Q9GZT8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NIF3L1Q9GZT8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NIF3L1Q9GZT8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NIF3L1Q9GZT8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NIF3L1Q9GZT8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NIF3L1Q9GZT8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NIF3L1Q9GZT8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NIF3L1Q9GZT8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NIF3L1Q9GZT8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NIF3L1Q9GZT8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NIF3L1Q9GZT8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NIF3L1Q9GZT8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NIF3L1Q9GZT8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NIF3L1Q9GZT8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NIF3L1Q9GZT8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NIF3L1Q9GZT8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NIF3L1Q9GZT8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NIF3L1Q9GZT8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NIF3L1Q9GZT8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NIF3L1Q9GZT8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NIF3L1Q9GZT8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NIF3L1Q9GZT8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NIF3L1Q9GZT8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
NIF3L1Q9GZT8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NIF3L1Q9GZT8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NIF3L1Q9GZT8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NIF3L1Q9GZT8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NIF3L1Q9GZT8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NIF3L1Q9GZT8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NIF3L1Q9GZT8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NIF3L1Q9GZT8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NIF3L1Q9GZT8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NIF3L1Q9GZT8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NIF3L1Q9GZT8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NIF3L1Q9GZT8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NIF3L1Q9GZT8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NIF3L1Q9GZT8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NIF3L1Q9GZT8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NIF3L1Q9GZT8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NIF3L1Q9GZT8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NIF3L1Q9GZT8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NIF3L1Q9GZT8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NIF3L1Q9GZT8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NIF3L1Q9GZT8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NIF3L1Q9GZT8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NIF3L1Q9GZT8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NIF3L1Q9GZT8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NIF3L1Q9GZT8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NIF3L1Q9GZT8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NIF3L1Q9GZT8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NIF3L1Q9GZT8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NIF3L1Q9GZT8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NIF3L1Q9GZT8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NIF3L1Q9GZT8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NIF3L1Q9GZT8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NIF3L1Q9GZT8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NIF3L1Q9GZT8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NIF3L1Q9GZT8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NIF3L1Q9GZT8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NIF3L1Q9GZT8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NIF3L1Q9GZT8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NIF3L1Q9GZT8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NIF3L1Q9GZT8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NIF3L1Q9GZT8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NIF3L1Q9GZT8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NIF3L1Q9GZT8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NIF3L1Q9GZT8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NIF3L1Q9GZT8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms