Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZS1

FOXP3, Forkhead box protein P3, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXP3Q9BZS1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOXP3Q9BZS1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOXP3Q9BZS1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOXP3Q9BZS1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FOXP3Q9BZS1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FOXP3Q9BZS1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FOXP3Q9BZS1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FOXP3Q9BZS1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FOXP3Q9BZS1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOXP3Q9BZS1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOXP3Q9BZS1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOXP3Q9BZS1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOXP3Q9BZS1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOXP3Q9BZS1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOXP3Q9BZS1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOXP3Q9BZS1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOXP3Q9BZS1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOXP3Q9BZS1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOXP3Q9BZS1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOXP3Q9BZS1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOXP3Q9BZS1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOXP3Q9BZS1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOXP3Q9BZS1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOXP3Q9BZS1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXP3Q9BZS1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXP3Q9BZS1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXP3Q9BZS1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXP3Q9BZS1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXP3Q9BZS1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOXP3Q9BZS1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOXP3Q9BZS1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOXP3Q9BZS1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOXP3Q9BZS1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOXP3Q9BZS1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOXP3Q9BZS1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOXP3Q9BZS1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOXP3Q9BZS1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOXP3Q9BZS1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOXP3Q9BZS1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOXP3Q9BZS1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOXP3Q9BZS1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOXP3Q9BZS1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
FOXP3Q9BZS1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOXP3Q9BZS1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOXP3Q9BZS1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOXP3Q9BZS1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOXP3Q9BZS1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOXP3Q9BZS1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOXP3Q9BZS1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FOXP3Q9BZS1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FOXP3Q9BZS1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FOXP3Q9BZS1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FOXP3Q9BZS1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FOXP3Q9BZS1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FOXP3Q9BZS1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FOXP3Q9BZS1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FOXP3Q9BZS1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FOXP3Q9BZS1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOXP3Q9BZS1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOXP3Q9BZS1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOXP3Q9BZS1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
FOXP3Q9BZS1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOXP3Q9BZS1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
FOXP3Q9BZS1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOXP3Q9BZS1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOXP3Q9BZS1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOXP3Q9BZS1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOXP3Q9BZS1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOXP3Q9BZS1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOXP3Q9BZS1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOXP3Q9BZS1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOXP3Q9BZS1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOXP3Q9BZS1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOXP3Q9BZS1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOXP3Q9BZS1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOXP3Q9BZS1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOXP3Q9BZS1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOXP3Q9BZS1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOXP3Q9BZS1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOXP3Q9BZS1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXP3Q9BZS1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXP3Q9BZS1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXP3Q9BZS1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXP3Q9BZS1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXP3Q9BZS1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXP3Q9BZS1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXP3Q9BZS1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXP3Q9BZS1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXP3Q9BZS1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXP3Q9BZS1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXP3Q9BZS1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXP3Q9BZS1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXP3Q9BZS1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXP3Q9BZS1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXP3Q9BZS1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXP3Q9BZS1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXP3Q9BZS1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXP3Q9BZS1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXP3Q9BZS1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXP3Q9BZS1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms