Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY19

MS4A8, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 8, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A8Q9BY19 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MS4A8Q9BY19 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MS4A8Q9BY19 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MS4A8Q9BY19 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MS4A8Q9BY19 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MS4A8Q9BY19 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MS4A8Q9BY19 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MS4A8Q9BY19 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MS4A8Q9BY19 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MS4A8Q9BY19 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MS4A8Q9BY19 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MS4A8Q9BY19 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MS4A8Q9BY19 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MS4A8Q9BY19 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MS4A8Q9BY19 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MS4A8Q9BY19 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MS4A8Q9BY19 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MS4A8Q9BY19 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MS4A8Q9BY19 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MS4A8Q9BY19 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MS4A8Q9BY19 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MS4A8Q9BY19 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MS4A8Q9BY19 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MS4A8Q9BY19 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MS4A8Q9BY19 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MS4A8Q9BY19 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MS4A8Q9BY19 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MS4A8Q9BY19 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MS4A8Q9BY19 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MS4A8Q9BY19 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MS4A8Q9BY19 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MS4A8Q9BY19 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MS4A8Q9BY19 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MS4A8Q9BY19 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MS4A8Q9BY19 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MS4A8Q9BY19 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MS4A8Q9BY19 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MS4A8Q9BY19 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MS4A8Q9BY19 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MS4A8Q9BY19 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MS4A8Q9BY19 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MS4A8Q9BY19 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MS4A8Q9BY19 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MS4A8Q9BY19 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MS4A8Q9BY19 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MS4A8Q9BY19 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MS4A8Q9BY19 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MS4A8Q9BY19 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MS4A8Q9BY19 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MS4A8Q9BY19 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MS4A8Q9BY19 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A8Q9BY19 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A8Q9BY19 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A8Q9BY19 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A8Q9BY19 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A8Q9BY19 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A8Q9BY19 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A8Q9BY19 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A8Q9BY19 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A8Q9BY19 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A8Q9BY19 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MS4A8Q9BY19 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MS4A8Q9BY19 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MS4A8Q9BY19 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MS4A8Q9BY19 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MS4A8Q9BY19 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A8Q9BY19 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A8Q9BY19 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A8Q9BY19 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A8Q9BY19 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A8Q9BY19 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A8Q9BY19 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A8Q9BY19 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A8Q9BY19 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MS4A8Q9BY19 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MS4A8Q9BY19 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A8Q9BY19 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A8Q9BY19 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A8Q9BY19 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A8Q9BY19 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A8Q9BY19 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A8Q9BY19 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A8Q9BY19 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MS4A8Q9BY19 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MS4A8Q9BY19 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MS4A8Q9BY19 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MS4A8Q9BY19 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MS4A8Q9BY19 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MS4A8Q9BY19 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MS4A8Q9BY19 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MS4A8Q9BY19 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MS4A8Q9BY19 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MS4A8Q9BY19 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MS4A8Q9BY19 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MS4A8Q9BY19 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MS4A8Q9BY19 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MS4A8Q9BY19 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MS4A8Q9BY19 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MS4A8Q9BY19 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MS4A8Q9BY19 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms