Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY5

CAPS2, Calcyphosin-2, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPS2Q9BXY5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPS2Q9BXY5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPS2Q9BXY5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPS2Q9BXY5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPS2Q9BXY5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPS2Q9BXY5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPS2Q9BXY5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPS2Q9BXY5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPS2Q9BXY5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPS2Q9BXY5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPS2Q9BXY5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPS2Q9BXY5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPS2Q9BXY5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPS2Q9BXY5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPS2Q9BXY5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPS2Q9BXY5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPS2Q9BXY5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPS2Q9BXY5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPS2Q9BXY5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPS2Q9BXY5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPS2Q9BXY5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPS2Q9BXY5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPS2Q9BXY5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPS2Q9BXY5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPS2Q9BXY5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPS2Q9BXY5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPS2Q9BXY5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPS2Q9BXY5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPS2Q9BXY5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPS2Q9BXY5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPS2Q9BXY5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPS2Q9BXY5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPS2Q9BXY5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CAPS2Q9BXY5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CAPS2Q9BXY5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPS2Q9BXY5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPS2Q9BXY5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPS2Q9BXY5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPS2Q9BXY5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPS2Q9BXY5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPS2Q9BXY5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPS2Q9BXY5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPS2Q9BXY5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPS2Q9BXY5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPS2Q9BXY5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPS2Q9BXY5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPS2Q9BXY5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPS2Q9BXY5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPS2Q9BXY5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPS2Q9BXY5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPS2Q9BXY5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPS2Q9BXY5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPS2Q9BXY5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPS2Q9BXY5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPS2Q9BXY5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPS2Q9BXY5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPS2Q9BXY5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPS2Q9BXY5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPS2Q9BXY5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPS2Q9BXY5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPS2Q9BXY5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPS2Q9BXY5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPS2Q9BXY5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPS2Q9BXY5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPS2Q9BXY5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPS2Q9BXY5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPS2Q9BXY5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPS2Q9BXY5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPS2Q9BXY5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPS2Q9BXY5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPS2Q9BXY5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPS2Q9BXY5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPS2Q9BXY5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPS2Q9BXY5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPS2Q9BXY5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPS2Q9BXY5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPS2Q9BXY5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPS2Q9BXY5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPS2Q9BXY5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPS2Q9BXY5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CAPS2Q9BXY5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPS2Q9BXY5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPS2Q9BXY5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPS2Q9BXY5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPS2Q9BXY5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPS2Q9BXY5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPS2Q9BXY5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPS2Q9BXY5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPS2Q9BXY5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPS2Q9BXY5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPS2Q9BXY5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPS2Q9BXY5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPS2Q9BXY5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPS2Q9BXY5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPS2Q9BXY5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPS2Q9BXY5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPS2Q9BXY5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPS2Q9BXY5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPS2Q9BXY5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPS2Q9BXY5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms