Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTT6

LRRC1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC1Q9BTT6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC1Q9BTT6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC1Q9BTT6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC1Q9BTT6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC1Q9BTT6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC1Q9BTT6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC1Q9BTT6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC1Q9BTT6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC1Q9BTT6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC1Q9BTT6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC1Q9BTT6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC1Q9BTT6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC1Q9BTT6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC1Q9BTT6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC1Q9BTT6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC1Q9BTT6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC1Q9BTT6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC1Q9BTT6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC1Q9BTT6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC1Q9BTT6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC1Q9BTT6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC1Q9BTT6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC1Q9BTT6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRC1Q9BTT6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRC1Q9BTT6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRC1Q9BTT6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRC1Q9BTT6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC1Q9BTT6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC1Q9BTT6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC1Q9BTT6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC1Q9BTT6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC1Q9BTT6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC1Q9BTT6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC1Q9BTT6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC1Q9BTT6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC1Q9BTT6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC1Q9BTT6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC1Q9BTT6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC1Q9BTT6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC1Q9BTT6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC1Q9BTT6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC1Q9BTT6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC1Q9BTT6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC1Q9BTT6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC1Q9BTT6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC1Q9BTT6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC1Q9BTT6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC1Q9BTT6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC1Q9BTT6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC1Q9BTT6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC1Q9BTT6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC1Q9BTT6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC1Q9BTT6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC1Q9BTT6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC1Q9BTT6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC1Q9BTT6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC1Q9BTT6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC1Q9BTT6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC1Q9BTT6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC1Q9BTT6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC1Q9BTT6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC1Q9BTT6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC1Q9BTT6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC1Q9BTT6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC1Q9BTT6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC1Q9BTT6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC1Q9BTT6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC1Q9BTT6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC1Q9BTT6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LRRC1Q9BTT6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC1Q9BTT6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC1Q9BTT6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC1Q9BTT6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC1Q9BTT6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC1Q9BTT6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC1Q9BTT6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC1Q9BTT6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC1Q9BTT6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC1Q9BTT6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC1Q9BTT6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC1Q9BTT6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC1Q9BTT6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC1Q9BTT6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC1Q9BTT6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC1Q9BTT6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC1Q9BTT6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC1Q9BTT6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC1Q9BTT6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC1Q9BTT6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC1Q9BTT6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC1Q9BTT6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC1Q9BTT6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC1Q9BTT6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC1Q9BTT6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC1Q9BTT6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC1Q9BTT6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC1Q9BTT6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC1Q9BTT6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC1Q9BTT6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC1Q9BTT6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms