Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS92

NIPSNAP3B, Protein NipSnap homolog 3B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3BQ9BS92 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NIPSNAP3BQ9BS92 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIPSNAP3BQ9BS92 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIPSNAP3BQ9BS92 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIPSNAP3BQ9BS92 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NIPSNAP3BQ9BS92 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NIPSNAP3BQ9BS92 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NIPSNAP3BQ9BS92 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NIPSNAP3BQ9BS92 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NIPSNAP3BQ9BS92 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NIPSNAP3BQ9BS92 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NIPSNAP3BQ9BS92 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NIPSNAP3BQ9BS92 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NIPSNAP3BQ9BS92 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NIPSNAP3BQ9BS92 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NIPSNAP3BQ9BS92 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NIPSNAP3BQ9BS92 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NIPSNAP3BQ9BS92 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NIPSNAP3BQ9BS92 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NIPSNAP3BQ9BS92 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NIPSNAP3BQ9BS92 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NIPSNAP3BQ9BS92 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NIPSNAP3BQ9BS92 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NIPSNAP3BQ9BS92 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NIPSNAP3BQ9BS92 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NIPSNAP3BQ9BS92 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NIPSNAP3BQ9BS92 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NIPSNAP3BQ9BS92 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NIPSNAP3BQ9BS92 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NIPSNAP3BQ9BS92 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NIPSNAP3BQ9BS92 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NIPSNAP3BQ9BS92 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NIPSNAP3BQ9BS92 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NIPSNAP3BQ9BS92 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NIPSNAP3BQ9BS92 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NIPSNAP3BQ9BS92 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NIPSNAP3BQ9BS92 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NIPSNAP3BQ9BS92 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NIPSNAP3BQ9BS92 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NIPSNAP3BQ9BS92 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NIPSNAP3BQ9BS92 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NIPSNAP3BQ9BS92 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIPSNAP3BQ9BS92 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIPSNAP3BQ9BS92 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIPSNAP3BQ9BS92 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIPSNAP3BQ9BS92 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIPSNAP3BQ9BS92 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIPSNAP3BQ9BS92 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NIPSNAP3BQ9BS92 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIPSNAP3BQ9BS92 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIPSNAP3BQ9BS92 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIPSNAP3BQ9BS92 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIPSNAP3BQ9BS92 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NIPSNAP3BQ9BS92 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIPSNAP3BQ9BS92 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIPSNAP3BQ9BS92 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIPSNAP3BQ9BS92 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NIPSNAP3BQ9BS92 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIPSNAP3BQ9BS92 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIPSNAP3BQ9BS92 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIPSNAP3BQ9BS92 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIPSNAP3BQ9BS92 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NIPSNAP3BQ9BS92 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPSNAP3BQ9BS92 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPSNAP3BQ9BS92 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPSNAP3BQ9BS92 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPSNAP3BQ9BS92 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPSNAP3BQ9BS92 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPSNAP3BQ9BS92 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPSNAP3BQ9BS92 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NIPSNAP3BQ9BS92 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIPSNAP3BQ9BS92 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NIPSNAP3BQ9BS92 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIPSNAP3BQ9BS92 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIPSNAP3BQ9BS92 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIPSNAP3BQ9BS92 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIPSNAP3BQ9BS92 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIPSNAP3BQ9BS92 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIPSNAP3BQ9BS92 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIPSNAP3BQ9BS92 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIPSNAP3BQ9BS92 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIPSNAP3BQ9BS92 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIPSNAP3BQ9BS92 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIPSNAP3BQ9BS92 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIPSNAP3BQ9BS92 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIPSNAP3BQ9BS92 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIPSNAP3BQ9BS92 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIPSNAP3BQ9BS92 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NIPSNAP3BQ9BS92 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NIPSNAP3BQ9BS92 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIPSNAP3BQ9BS92 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIPSNAP3BQ9BS92 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIPSNAP3BQ9BS92 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIPSNAP3BQ9BS92 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIPSNAP3BQ9BS92 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms